cBioPortal:膀胱尿路上皮癌(TCGA,Firehose 旧版)

该数据集与 TCGA 膀胱尿路上皮癌相关,源数据来自 GDAC Firehose,并且曾经使用 TCGA Provisional 这一名称

cbioportal
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蛋白质blca
cBioPortal: Bladder Urothelial Carcinoma (TCGA, Firehose Legacy)

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

cBioPortal:膀胱尿路上皮癌(TCGA,Firehose 旧版)

这是一个收录于 cbioportal.org 的膀胱尿路上皮癌数据集,英文名称为 cBioPortal: Bladder Urothelial Carcinoma (TCGA, Firehose Legacy),在本地分类中归入“肿瘤 / 其他”,主题标签为 blca。其源站标题为 Bladder Urothelial Carcinoma (TCGA, Firehose Legacy),简短描述与标题一致。该数据集与 TCGA 膀胱尿路上皮癌相关,源数据来自 GDAC Firehose,并且曾经使用 TCGA Provisional 这一名称。

【数据集背景】

根据来源站描述,该资源围绕 TCGA Bladder Urothelial Carcinoma 构建,源数据来自 GDAC Firehose。来源站还注明它以前被称为 TCGA Provisional。这意味着当前名称中的 Firehose Legacy 与历史命名之间具有沿革关系。除这些信息外,关于该数据集的研究项目背景、发起机构、协作网络、伦理审批、项目周期、更新历史等,源站未提供。

【数据内容】

就目前可确认的信息而言,该数据集的主题标签是 blca,类别归属为肿瘤 / 其他,标题和简短描述均指向膀胱尿路上皮癌。除此之外,关于其包含哪些组学层面、样本数量、癌种亚型、临床字段、突变、拷贝数、表达、甲基化、蛋白、生存随访、治疗信息等具体内容,源站未提供。因此无法从现有信息判断其数据表结构、文件格式或变量字典。任何关于具体分子特征或统计指标的描述都缺乏依据。

【采集与来源】

该数据集的来源站是 cbioportal.org。来源站描述中写明,其源数据来自 GDAC Firehose。该资源与 TCGA 膀胱尿路上皮癌有关,且曾以 TCGA Provisional 名称出现。关于采集地点、采集时间、样本处理、测序平台、数据处理流程、质控步骤、版本迁移细节等,源站未提供。

【适用场景】

源站未提供明确的适用场景说明。基于已知分类和主题标签,可以确认它与肿瘤 / 其他分类以及 blca 标签相关,但不宜进一步推断其适用于何种具体分析、临床决策或研究设计。若需要了解该数据集能否用于特定科研、教学、药物靶点发现、生物标志物探索或临床解读,应回到来源站查看其说明。源站是否给出这些用途说明,未提供。

【使用方法】

源站未提供具体使用方法,包括访问入口、浏览方式、下载方式、API 调用、账号权限、数据格式转换、分析工具衔接等。仅可以确认该数据集可通过来源站 cbioportal.org 识别和检索,因为其来源站为 cbioportal.org。关于是否需要注册、是否支持批量下载、是否提供教程、是否允许本地部署等,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供质量评估、完整性、准确性、缺失值、批次效应、样本代表性、版本差异、已知问题或使用限制等说明。可以确认的是,来源站描述提到其源数据来自 GDAC Firehose,并曾称为 TCGA Provisional,当前名称为 Bladder Urothelial Carcinoma (TCGA, Firehose Legacy)。这些名称和来源信息提示数据存在历史版本沿革,但具体差异、迁移影响、是否与更新版本一致,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、许可协议、使用条款、版权归属、二次分发限制、商业使用规定或联系方式。由于来源站为 cbioportal.org,使用者如要引用或再分发,应前往该来源站核实相关要求。关于该数据集的具体许可与引用规范,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=blca_tcga

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

TCGA 膀胱尿路上皮癌。源数据来自 GDAC Firehose。曾称为 TCGA Provisional。

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