cBioPortal：尿路上皮癌（Cornell/Trento，Nat Gen 2016）

资源简介

cBioPortal：尿路上皮癌（Cornell/Trento，Nat Gen 2016）

该数据集是在 cbioportal.org 上收录的尿路上皮癌研究数据，英文名称为 cBioPortal: Urothelial Carcinoma (Cornell/Trento, Nat Gen 2016)，来源页面标题为 Urothelial Carcinoma (Cornell/Trento, Nat Gen 2016)。其核心内容是对尿路上皮癌开展的全外显子测序，涉及72个肿瘤样本，并包含32个匹配正常样本。相关标签为 blca，在该平台被归入“肿瘤 / 其他”分类。

【数据集背景】

围绕该数据集的详细研究背景，例如研究动机、队列设计缘由、机构协作背景、发表期刊的具体信息等，源站未提供。可确认的是，来源页面标题中出现了 Cornell/Trento 与 Nat Gen 2016 字样，说明该条目的命名与这些标识相关。其文献标识为 pmid:27749842。整体上，这一数据集属于肿瘤基因组学资源，聚焦尿路上皮癌，相关标签为 blca。更具体的疾病亚型、分期、人群构成、治疗史和随访信息，源站未提供。

【数据内容】

来源页面说明，该数据集包含对尿路上皮癌进行的全外显子测序，共有72个肿瘤样本，并配有32个匹配正常样本。这里的“匹配正常样本”意味着部分肿瘤样本有对应的正常对照，可用于区分胚系与体细胞变异；但哪些样本构成配对、配对比例如何、其余样本是否无正常对照，源站未提供。数据中是否包含突变列表、拷贝数变异、表达数据、临床注释、生存信息、样本元数据、原始测序读段或仅包含处理后结果，源站未提供。数据文件格式、体积、下载方式、版本号、更新日期等，源站未提供。该条目的简短描述与来源页面标题一致，均指向 Urothelial Carcinoma (Cornell/Trento, Nat Gen 2016)。

【采集与来源】

该数据集的来源站点为 cbioportal.org。来源页面将其标题写为 Urothelial Carcinoma (Cornell/Trento, Nat Gen 2016)，并说明其内容为 Whole-exome sequencing of 72 tumor samples (with 32 matched normals) in Urothelial Carcinoma。相关的文献标识为 pmid:27749842。关于样本采集机构、采集地点、采集时间、伦理审批、知情同意、样本处理流程、测序平台、测序深度、建库方法、质控标准以及数据处理流程，源站未提供。除 cbioportal.org 与 pmid:27749842 之外，其他外部数据库交叉链接或原始数据存放位置，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于围绕尿路上皮癌的全外显子测序数据浏览与探索，也可用于需要肿瘤样本与匹配正常样本对照的研究场景。由于相关标签为 blca，它在平台中可用于相关数据检索。具体适用于哪些分析，例如体细胞突变筛选、肿瘤突变负荷评估、驱动事件识别、拷贝数分析、生存关联分析或治疗反应研究，源站未提供明确说明。若研究者希望将其用于特定课题，应结合来源站条目和文献标识进一步确认数据类型与可用字段。除上述方向外，其他专门适用场景源站未提供。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法，例如如何在 cbioportal.org 中检索、浏览、筛选、下载或通过 API 访问，源站未提供说明。是否提供原始测序数据、处理后矩阵、临床数据表或可视化报告，源站未提供。使用前应前往 cbioportal.org 查看该标题对应的条目，并依据平台提示操作。若需要引用或复现分析，应结合 pmid:27749842 查找相关文献信息。更详细的下载权限、账号要求、分析工具和操作步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集已知包含72个肿瘤样本和32个匹配正常样本。匹配正常样本数量少于肿瘤样本数量，但这是否影响配对分析、样本中是否存在重复或不合格样本、测序质量如何、覆盖均一性如何、是否有批次效应、临床注释是否完整，源站未提供。数据的完整性、准确性、更新状态、错误修正记录、缺失值处理方式以及是否经过独立验证，源站未提供。因此，使用时应自行评估数据质量，并查看来源站与相关文献中的说明。除样本数量与测序类型外，其他质量指标和限制条件源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时，可参考其来源站 cbioportal.org 与文献标识 pmid:27749842，并使用来源页面标题 Urothelial Carcinoma (Cornell/Trento, Nat Gen 2016) 进行标识。关于许可协议、使用条款、再分发条件、商业使用限制、署名要求、原始数据版权和数据下载后的合规要求，源站未提供。若需正式引用或再利用，应前往 cbioportal.org 查看对应条目，并结合 pmid:27749842 获取文献层面的引用信息。更具体的许可与授权说明源站未提供。