犬腹股沟隐睾睾丸miRNA表达谱改变数据集

该数据集来自NCBI GEO(GSE308086),比较单侧腹股沟隐睾犬的未下降睾丸、下降睾丸及对照犬阴囊睾丸中小非编码RNA的表达谱

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基因组分类GPL257609615
GSE308086: Altered expression profile of miRNAs in canine inguinal testes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

犬腹股沟隐睾睾丸miRNA表达谱改变数据集

Altered expression profile of miRNAs in canine inguinal testes

该数据集来自NCBI GEO(GSE308086),比较单侧腹股沟隐睾犬的未下降睾丸、下降睾丸及对照犬阴囊睾丸中小非编码RNA的表达谱。研究采用sncRNA-seq方法,纳入隐睾犬9例、对照犬8例,鉴定出未下降与下降睾丸间224个差异表达miRNA,以及未下降与对照睾丸间200个差异表达miRNA。数据可用于犬隐睾症相关miRNA标志物筛选及表观遗传调控机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):隐睾症是犬的一种主要性发育障碍(DSD),具有复杂的多基因背景。已知在犬未下降睾丸中,蛋白编码基因的表达出现大规模上调或下调,并与某些表观遗传修饰相关。本研究旨在比较未下降(UD)和下降(D)睾丸中小非编码RNA(sncRNA)的表达谱。采用小非编码RNA测序(sncRNA-seq)方法分析单侧腹股沟隐睾犬的未下降(UD)和下降(D)睾丸(n=9),以及对照犬的阴囊睾丸(C,n=8)。UD与D睾丸比较发现224个差异表达miRNA(DEGs),其中118个满足FDR 1.5标准(8个上调、110个下调)。类似地,UD与C睾丸比较鉴定出200个DEGs,其中102个满足相同标准(9个上调、9个

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL25760、9615。本站分类:泌尿生殖系统疾病/隐睾症。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308086

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 07 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

隐睾症是犬类一种主要的性发育障碍(DSD),具有复杂的多基因背景。已知在犬类未下降睾丸中,蛋白编码基因的表达出现大规模上调或下调,并与某些表观遗传修饰相关。本研究旨在比较未下降(UD)睾丸与下降(D)睾丸中小非编码RNA(sncRNA)的表达谱。采用小非编码RNA测序(sncRNA-seq)方法,对单侧腹股沟隐睾犬(n=9)的未下降(UD)睾丸和下降(D)睾丸,以及对照犬(C,n=8)的阴囊睾丸进行了分析。UD与D睾丸的比较揭示了224个差异表达的miRNA(DEGs),其中118个符合FDR < 0.05且|log2FC| > 1.5的标准(8个上调,110个下调)。同样,UD与C睾丸的比较鉴定出200个DEGs,其中102个符合相同标准(9个上调,93个下调)。

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