天然隐睾哺乳动物受精相关基因演化数据集

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Evolution of fertilization-related genes provides insights into reproductive health in natural ascrotal mammals
• DOI：10.6084/m9.figshare.17059700.v1
• 发布日期：2021-11-22
• 文件数：1 个
• 文件总体积：4.43 MB
• 源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Evolution_of_fertilization-related_genes_provides_insights_into_reproductive_health_in_natural_ascrotal_mammals/17059700

命令行下载

curl -L -o "figshareDATABASE-20211122.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/31546823"

文件清单

• figshareDATABASE-20211122.zip（4.43 MB）

文件总体积 4.43 MB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

隐睾是指一侧或双侧睾丸未能下降至阴囊底部。这种在人类和家养动物中常见的先天性畸形，是精子功能异常和不育症最具特征性的风险因素。然而，目前的隐睾治疗方法并不能确保所有病例都能实现父权。一些哺乳动物谱系（如大象和鲸类）具有自然无阴囊睾丸（即未下降或未完全下降的睾丸），且精子活力和生育能力正常，这为理解隐睾的遗传基础提供了机会。我们从四个与受精相关的基因集中上传了264个蛋白质编码序列（CDSs），这四个基因集分别是：（1）获能/去获能，（2）精子活力，（3）精子竞争/受精，以及（4）顶体反应和透明带反应，涵盖了20个主要哺乳动物目的49个代表性分类群。在本研究中，我们发现与无阴囊哺乳动物精子活力和竞争/生育力相关的基因经历了频繁且强烈的选择压力。

特定氨基酸的固定以及无阴囊哺乳动物中的正选择可能影响受精相关蛋白的理化性质与功能。在比较隐睾和不完全下降睾丸的哺乳动物时，显示出适应性进化证据的基因差异及功能富集差异表明，多种分子机制共同作用于在充满挑战的睾丸环境中维持生育能力。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.17059700.v1（source: https://figshare.com/articles/dataset/Evolution_of_fertilization-related_genes_provides_insights_into_reproductive_health_in_natural_ascrotal_mammals/17059700）。