婴儿肠道真菌组成熟及其决定因素：shotgun宏基因组与ITS2扩增子测序方法比较

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA903921

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

样本来自作为“微生物组、抗生素与婴儿生长队列”（MAGIC）研究的一部分招募的受试者。 enrolled children born at Pennsylvania Hospitals 的粪便样本在出生后几天内采集，之后每三个月采集一次，直至婴儿满24个月。在每个时间点收集每位受试者的人口统计学信息，包括抗生素使用和暴露情况。DNA提取后采用两种方法进行测序：鸟枪法宏基因组测序和ITS2扩增子测序。该数据集可用于在抗生素暴露和对照婴儿群体中，比较和对比婴儿肠道真菌组发育背景下的测序方法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。