PRJNA741555:肾小球疾病基因组学研究
“肾小球疾病基因组学研究”旨在识别原发性肾小球病的遗传贡献。该存储库共纳入 N = 4,238 例经肾活检诊断为原发性肾小球疾病的患者,涵盖以下类别:局灶节段性肾小球硬化(FSGS,N = 583)、过敏性紫癜性肾炎(HSPN,N = 403)、IgA 肾病(IgAN,N = 1,555)、膜性肾病

基本信息
资源简介
PRJNA741555:肾小球疾病基因组学研究
PRJNA741555(Genomics of Glomerular Disorders)是一项聚焦原发性肾小球疾病遗传学基础的研究数据集,来源于 ncbi.nlm.nih.gov,在本站归类于泌尿生殖系统疾病 / 其他。该研究旨在识别原发性肾小球病的遗传贡献,共纳入 4,238 例经肾活检确诊为原发性肾小球疾病的患者,覆盖局灶节段性肾小球硬化(FSGS,583 例)、过敏性紫癜性肾炎(HSPN,403 例)、IgA 肾病(IgAN,1,555 例)、膜性肾病(MN,1,003 例)和微小病变肾病(MCD,694 例)五个疾病类别。患者分别来自 Cure Glomerulonephropathy(CureGN)研究和哥伦比亚大学 CKD Biobank,为肾小球疾病遗传学研究提供了规模可观的样本资源。
【数据集背景】
原发性肾小球病是一组以肾小球结构损伤为主要特征的肾脏疾病,其发病机制涉及遗传因素。该研究以“Genomics of Glomerular Disorders”为主题,目标在于识别原发性肾小球病的遗传贡献,即通过基因组学手段探索上述疾病类别背后的遗传学基础。数据集围绕经肾活检诊断的原发性肾小球疾病患者构建,涵盖 FSGS、HSPN、IgAN、MN 和 MCD 五种主要病理类型,体现了对原发性肾小球病进行系统性遗传学研究的定位。
【数据内容】
该存储库共包含 4,238 例经肾活检诊断为原发性肾小球疾病的患者。按疾病类别划分:局灶节段性肾小球硬化(FSGS)583 例,过敏性紫癜性肾炎(HSPN)403 例,IgA 肾病(IgAN)1,555 例,膜性肾病(MN)1,003 例,微小病变肾病(MCD)694 例。各表型的样本量按入组诊断进行计数。从招募来源看,2,290 例患者来自 Cure Glomerulonephropathy(CureGN)研究,另有 1,948 例来自哥伦比亚大学 CKD Biobank(即非 CureGN 患者)。数据集的具体组学数据类型、检测平台和文件构成,源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。患者样本通过两个渠道招募:一是 Cure Glomerulonephropathy(CureGN)研究,纳入 2,290 例;二是哥伦比亚大学 CKD Biobank,纳入 1,948 例非 CureGN 患者。所有纳入患者均具有肾活检诊断的原发性肾小球疾病,样本量按入组诊断统计。关于样本采集时间、地理范围、伦理审批及知情同意等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于原发性肾小球疾病的遗传学研究,包括识别与 FSGS、HSPN、IgAN、MN 和 MCD 相关的遗传贡献,开展候选基因或全基因组层面的关联分析,以及比较不同肾小球病理类型之间的遗传特征。由于样本来自 CureGN 研究与哥伦比亚大学 CKD Biobank 两个队列,也可用于跨队列的遗传学验证或合并分析。具体适用分析类型需结合源站提供的实际数据类型确定,源站未提供进一步的适用性说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据访问方式、下载格式、分析流程及配套工具等信息。使用者需参考 dbGaP 研究页面获取进一步说明。
【质量与限制】
该数据集的样本量按入组诊断计数,各疾病类别样本量差异较大,其中 IgAN 最多(1,555 例),HSPN 最少(403 例)。患者来自两个不同来源队列(CureGN 与非 CureGN 的哥伦比亚大学 CKD Biobank),队列间可能存在的差异需在使用中加以考虑。关于数据质量评估、缺失情况、诊断标准一致性及潜在偏倚等信息,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可条款。使用时应参考 dbGaP 研究页面(PRJNA741555)获取正式的引用与数据使用要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA741555
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
“肾小球疾病基因组学”研究的目的是识别原发性肾小球病的遗传因素。该数据库共纳入N = 4,238例经肾活检诊断为原发性肾小球疾病的患者,涵盖以下类别:局灶节段性肾小球硬化(FSGS,N = 583)、过敏性紫癜肾炎(HSPN,N = 403)、IgA肾病(IgAN,N = 1,555)、膜性肾病(MN,N = 1,003)和微小病变肾病(MCD,N = 694)。该数据集共包括2,290例纳入Cure Glomerulonephropathy(CureGN)研究的患者,以及来自哥伦比亚大学CKD生物样本库的另外1,948例患者(即非CureGN患者)。各表型的样本量按入组诊断计数。该数据库……(更多内容见dbGaP研究页面。)
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