PRJNA1543739：姜黄素介导PK-15细胞抗赭曲霉毒素A毒性的RNA-seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1543739

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

赭曲霉毒素A（OTA）是一种广泛存在的真菌毒素，可引起人和动物的肾毒性，但其毒性背后的分子机制及可能的保护性干预措施仍未被完全阐明。已有报道称，姜黄素在多种OTA暴露模型中具有抗氧化和抗炎作用；然而，其在猪肾细胞中的转录组学基础尚未得到系统表征。在本研究中，我们对猪肾细胞系PK-15（Sus scrofa）在四种处理条件下进行了链特异性RNA测序（RNA-seq）：（1）溶剂处理的对照细胞，（2）单独暴露于OTA的细胞，（3）单独用姜黄素预处理的细胞，（4）先用姜黄素预处理后再暴露于OTA的细胞。每组由三个独立的生物学重复组成。通过差异基因表达分析和功能富集分析，鉴定了受OTA扰动并被姜黄素预处理调节的通路。该数据集为研究OTA诱导的肾毒性以及姜黄素介导的肾脏细胞保护作用的分子机制提供了转录组学资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。