膜性肾病外泌体miRNA表达谱
该数据集为 NCBI BioProject 收录的膜性肾病外泌体 miRNA 表达谱项目,编号 PRJNA1458574,主题标签为 Raw sequence reads,属于泌尿生殖系统疾病分类

基本信息
资源简介
膜性肾病外泌体miRNA表达谱
PRJNA1458574 是 NCBI BioProject 数据库中收录的一个生物项目,英文名称为“Exosomal miRNA expression profiling in membranous nephropathy”,即膜性肾病外泌体 miRNA 表达谱项目。该项目在源站上的编号为 1458574,主题标签为 Raw sequence reads,表明其数据以原始测序读段的形式呈现。按照本站分类,该数据集归属于泌尿生殖系统疾病 / 其他类别,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集生物数据的记录集合,通常来自单一机构或联合体,并为用户提供统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集聚焦于膜性肾病这一泌尿生殖系统疾病背景下外泌体 miRNA 的表达谱,属于原始测序数据类型的生物项目记录。
【数据集背景】
膜性肾病是一种与泌尿生殖系统相关的疾病,外泌体 miRNA 表达谱研究通常关注外泌体中所携带的微小 RNA 在特定疾病状态下的表达变化。该数据集以 BioProject 形式组织,项目英文名称明确指向膜性肾病中的外泌体 miRNA 表达谱分析。源站描述指出,BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合,来源于单一组织或联合体,并为用户提供查找该项目所生成的不同数据类型链接的统一位置。该项目的主题标签为 Raw sequence reads,说明其核心数据形态为原始序列读段。本站将其归入泌尿生殖系统疾病 / 其他分类,源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,即原始序列读段。项目英文名称表明其内容为膜性肾病中外泌体 miRNA 的表达谱。源站描述说明 BioProject 记录提供用户单一位置以查找该项目生成的不同数据类型的链接。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、测序平台、读段长度、数据量、miRNA 种类或表达定量结果等具体内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“ID 1458574 - BioProject - NCBI”,项目编号为 PRJNA1458574。源站描述指出 BioProject 可来自单一组织或联合体,但关于该项目的具体提交机构、样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及实验设计细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签 Raw sequence reads 和项目名称所指向的膜性肾病外泌体 miRNA 表达谱,该数据集可用于与膜性肾病相关的 miRNA 表达分析、外泌体 miRNA 研究以及原始测序数据的再分析等通用场景。由于本站分类将其归入泌尿生殖系统疾病 / 其他,也可作为该疾病领域生物项目记录的检索入口。关于该数据集在具体研究中的适用性、可重复性以及与其他数据集的整合方式,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式提供,用户可通过项目编号 PRJNA1458574 在 ncbi.nlm.nih.gov 上定位该记录。源站描述指出,BioProject 记录为用户提供单一位置以查找该项目生成的不同数据类型的链接。关于如何下载原始序列读段、使用何种工具处理数据、是否需要配套的参考基因组或注释文件,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,属于原始测序读段类型。源站描述仅对 BioProject 的一般性质作出说明,未提供该项目的质量控制指标、数据完整性评估、污染筛查结果或批次效应等信息。关于样本量、测序深度、覆盖度以及可能影响解释的混杂因素,源站未提供。因此,使用该数据集时需注意其具体质量与限制信息在源站记录中并未给出。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 PRJNA1458574,源站标题为“ID 1458574 - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制以及是否需要获得额外授权,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1458574
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含源自膜性肾病患者和健康对照者血清样本的外泌体微小RNA的高通量测序数据。从血清中分离出外泌体,并进行了小RNA测序以分析miRNA表达模式。该数据集旨在表征与膜性肾病相关的外泌体miRNA特征,并促进用于疾病诊断和分子研究的生物标志物发现。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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