estrildid finch与非estrildid鸟类卵巢生理状态单细胞RNA-seq数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1432434

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

大量研究聚焦于人类促卵泡激素受体（FSHR）中的致病性功能获得性突变，例如p.Thr449Ala，该突变可在自然妊娠或冻融胚胎移植后引起自发性卵巢过度刺激综合征（sOHSS）。然而，OHSS的完整分子病理生理机制及治疗方案仍不明确。有趣的是，在梅花雀科鸟类的FSHR中，第449位点天然存在同源的苏氨酸至丙氨酸替换（T449A）。该变异赋予受体更高的组成型活性及对hCG的敏感性，但梅花雀科鸟类并不发生OHSS。为探究梅花雀科鸟类的进化抗性机制，我们对生理条件下成年雌鸟的卵巢进行了单细胞RNA测序。我们的分析包括两种梅花雀科鸟类——斑胸草雀和白腰文鸟——以及一种非梅花雀科对照物种，金丝雀。我们对斑胸草雀和金丝雀使用了三个生物学重复，对白腰文鸟使用了两个生物学重复。

通过分析这个单细胞转录组数据集，我们旨在阐明保护梅花雀免受OHSS影响的细胞和分子适应性机制，尽管它们携带FSHR T449A变异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。