MELTF-AS1敲低HTR-8/SVneo细胞的RNA-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1369495

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该研究包括两种实验条件：1. MELTF-AS1敲低组： 使用靶向MELTF-AS1基因的特异性siRNA转染HTR-8/SVneo细胞。2. 对照组： 使用非靶向 scramble siRNA 处理HTR-8/SVneo细胞。本项目旨在识别由MELTF-AS1功能缺失导致的差异表达基因（DEGs）和失调的信号通路。由于HTR-8/SVneo细胞是研究滋养层侵袭和胎盘形成的成熟模型，该数据为了解MELTF-AS1在妊娠相关疾病（如子痫前期，其中滋养层侵袭不足是关键病理特征）分子病因学中的潜在作用提供了宝贵资源。研究人员可利用该数据集探索胎盘发育和疾病中lncRNA介导的调控网络。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。