基本信息

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基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

小鼠肾上主动脉组织5天Angiotensin II输注后的转录组分析

PRJNA1269572 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，全称为 Transcriptomic Profiling of Suprarenal Aortic Tissue from Mice Following 5-Day Angiotensin II Infusion。该项目围绕小鼠在连续 5 天输注 Angiotensin II 之后采集的肾上主动脉组织展开转录组分析，主题标签为 Raw sequence reads。作为 BioProject 体系下的一条记录，它把与这一研究计划相关的多种数据类型集中在一个入口下，便于使用者查找和定位原始测序读取等数据资源。该数据集在分类上归入泌尿生殖系统疾病 / 其他，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示为 ID 1269572 - BioProject - NCBI。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级记录形式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物数据。按照源站描述，一个 BioProject 可以来自单一机构，也可以来自一个联合体，其作用是为用户提供一个统一的位置，以便找到该项目所产生的不同类型的数据。PRJNA1269572 正是在这一框架下建立的项目记录，其研究主题聚焦于小鼠肾上主动脉组织在连续 5 天输注 Angiotensin II 后的转录组变化。该项目的源站标题为 ID 1269572 - BioProject - NCBI，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，说明其涉及的数据类型以原始序列读取为主。项目全称表明，研究对象为小鼠的肾上主动脉组织，实验条件为连续 5 天输注 Angiotensin II，分析角度为转录组分析。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、数据量、基因表达矩阵或差异表达结果等更具体的内容。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1269572，英文名称为 PRJNA1269572: Transcriptomic Profiling of Suprarenal Aortic Tissue from Mice Following 5-Day Angiotensin II Infusion。源站描述仅对 BioProject 的一般性质作了说明，即 BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录，可来自单一机构或联合体，并为用户提供查找多种数据类型的统一入口。关于样本采集地点、实验机构、伦理审批信息、动物品系、Angiotensin II 的具体给药方式与剂量等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于关注小鼠肾上主动脉组织转录组的研究场景，尤其是与连续 5 天输注 Angiotensin II 相关的实验条件。由于主题标签为 Raw sequence reads，它可用于需要从原始序列读取出发进行重新分析、流程验证或方法比较的工作。该记录归入泌尿生殖系统疾病 / 其他分类，因此也可能为相关疾病领域的生物信息学检索提供入口。除此之外，源站未提供关于具体适用场景的进一步说明。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 记录 ID 1269572 或项目英文名称 PRJNA1269572 进行检索和访问。BioProject 记录的设计目的之一，是让用户在一个统一位置找到该项目关联的不同数据类型，因此可借助该记录跳转至相关的原始序列读取等资源。关于数据下载方式、分析流程、软件参数或参考基因组等信息，源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、测序深度、覆盖度、重复数、批次效应或质控结果的具体信息。该记录为 BioProject 项目级条目，其源站描述仅解释 BioProject 的一般功能，并未给出该项目的实验细节或分析结论。因此，在缺乏更多原始数据说明的情况下，使用者需注意该记录本身不构成对数据质量或生物学结论的保证。相关限制信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可条款或使用限制。使用者如需引用或再利用，应自行查阅 NCBI BioProject 记录及相关数据页面中的最新说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1269572

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1269572

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自C57BL/6J小鼠的肾上主动脉组织的批量RNA测序数据，这些小鼠分别接受了生理盐水或血管紧张素II（AngII，1,000 ng/kg/min）输注5天。目的是探究与腹主动脉瘤（AAA）起始相关的早期转录反应。每组包括生物学重复（n=4），测序是对从无壁内出血或夹层的灌注主动脉组织段提取的总RNA进行的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别