肾上腺中受调控基因对PACAP的依赖性

该数据集来自ebi.ac.uk,研究PACAP基因敲除对小鼠肾上腺转录组谱的影响。实验使用含35,546个克隆的小鼠cDNA微阵列,比较野生型与PACAP敲除小鼠肾上腺总RNA的转录变化,芯片包含13,217个Entrez基因ID和15,888个Unigene ID,其余为注释不完整的IMAGE克隆

biostudies
浏览 13
基因组分类unknown experiment typeMus musculus
PACAP dependency of genes regulated in adrenal gland

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

肾上腺中受调控基因对PACAP的依赖性

PACAP dependency of genes regulated in adrenal gland

该数据集来自ebi.ac.uk,研究PACAP基因敲除对小鼠肾上腺转录组谱的影响。实验使用含35,546个克隆的小鼠cDNA微阵列,比较野生型与PACAP敲除小鼠肾上腺总RNA的转录变化,芯片包含13,217个Entrez基因ID和15,888个Unigene ID,其余为注释不完整的IMAGE克隆。数据可用于分析PACAP依赖的肾上腺基因表达调控(来源 BioStudies)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们研究了PACAP敲除对肾上腺转录组谱的影响。使用含35,546个克隆的小鼠cDNA微阵列研究转录变化。关键词:转录本鉴定设计。在所采用的杂交方法中,分别用两种不同的荧光染料(Cy3或Cy5)标记来自野生型和PACAP敲除小鼠组肾上腺的等量(2-5 ug/15.5 ul)总RNA,并应用于同一NIMH Mouse 36K cDNA微阵列芯片,该芯片包含13217个不同的Entrez基因ID(以前称为LocusLink)和15888个不同的Unigene ID,其余为注释不完整的IMAGE克隆。探针制备和杂交按如下进行。将总RNA(15-50 ug,溶于15.5 ul)与胺修饰随机引物(2 ug/ul,2 ul)和RNase抑制剂(5单位/ul,1 ul)在70C孵育10分钟。引物-RNA溶

【主题与分类】

主题标签:unknown experiment type、Mus musculus。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-7405

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

E-GEOD-7405 肾上腺中受调控基因对PACAP的依赖性 未知实验类型 小家鼠 我们研究了PACAP基因敲除对肾上腺转录组谱的影响。使用含有35,546个克隆的小鼠cDNA微阵列来探究转录变化 关键词

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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