神经嵴介导的Gas1表达调控发育与演化中的物种特异性颌骨大小

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Afd4e3fc24a24182edcf060c82655efcc36dd07c29bf770f149b1f591eaae3856

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数据说明

颌骨大小的发育调控对于预防出生缺陷和促进进化适应至关重要。我们已经证明，颌骨大小由神经嵴间充质（NCM）建立，NCM是迁移进入下颌原基并产生颌骨的祖细胞。NCM依赖多种信号通路，包括Sonic Hedgehog（SHH），来介导与下颌上皮的相互作用并促进颌骨生长。生长停滞特异性蛋白1（GAS1）是SHH的共受体，其在鸭下颌原基中的表达量比鹌鹑高20-75倍。在NCM中过表达和敲低Gas1会改变细胞数量和下颌原基大小。

为分析Gas1的物种特异性差异表达如何调控Shh通路以及其他指导下颌原基发育的信号通路，我们在白羽北京鸭（Anas platyrhynchos domestica）和日本鹌鹑（Coturnix coturnix japonica）胚胎中过表达并敲低了GAS1……，# 神经嵴介导的Gas1表达在发育和演化过程中调控物种特异性颌骨大小 数据集DOI：10.5061/dryad.1g1jwsvc5 ## 数据及文件结构说明 数据为Illumina NovaSeq双端150 bp测序的mRNA测序结果。于HH24期从北京鸭（D，Anas platyrhynchos domestica）和日本鹌鹑（Q，Coturnix coturnix japonica）胚胎中采集下颌原基进行mRNA测序。胚胎分别为对照组、过表达Gas1组（OE）或注射Gas1 vivo-morpholino组（MO）。

文件与变量

文件：D24Gas1OE_11.fastq.gz

描述： 鸭 HH24 Gas1 过表达样本 11

文件：Q24Gas1OE_1.fastq.gz

描述： 鹌鹑 HH24 Gas1 过表达样本 1

文件：D24Gas1OE_10.fastq.gz

描述： 鸭 HH24 Gas1 过表达样本 10

文件：Q24_4.fastq.gz

描述： 鹌鹑 HH24 样本 4

文件：Q24Gas1MO_16.fastq.gz

描述：……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。