冈比亚按蚊胚胎发育性别特异性转录组动态 [Ag55 CUT&Tag]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297043

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

传播疟疾的蚊子在解剖结构和行为上表现出极端的性二态性。冈比亚按蚊的性别特异性基因表达在成虫阶段已有充分研究，但其在胚胎发生过程中的起始情况，除Yob等性别决定因子外，仍 largely 未知。在此，我们报道了冈比亚按蚊雌雄个体的全面单胚胎转录组图谱，以理解性别特异性表达网络建立的最早阶段。我们的数据集揭示了胚胎RNA异构体多样性，包括在母体到合子基因组转变过程中向远端选择性多聚腺苷酸化（APA）位点的全局性转变。性别偏向性基因表达和选择性剪接在胚胎发生过程中有限，大多数性别特异性模式在胚胎后出现。X染色体剂量补偿在合子基因组激活后不久建立，与主调控蛋白SOA直接结合X连锁启动子同时发生。与果蝇和哺乳动物中的剂量补偿调控因子相比，我们在按蚊中发现早期结合位点或距离依赖性模式的证据相当薄弱。

相反，补偿与结合往往在局部发生，并在基因和发育阶段间保持一致。表达量最高的基因通常表现出最强的SOA结合。我们提出，按蚊的剂量补偿系统代表了一种基因逐一调控机制在染色体水平上运作的极端案例。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。