GSE240031：鲤科杂交鱼头肾转录组分析揭示与SVCV感染相关的杂种优势与衰退

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240031

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

F1代杂交种通常在适合度相关性状（包括对寄生虫的抗性）上表现出杂种优势，而F1代之后的世代由于Dobzhansky–Muller遗传不相容性，会表现出众多不利性状（包括对寄生虫的易感性）。杂交种中的遗传紊乱也可能源于细胞核-细胞质协同适应系统的破坏。母本回交（每个亲本与亲本具有相同的mtDNA）和父本回交（每个亲本与亲本具有不同的mtDNA）具有相同的核遗传组成，但在细胞质遗传元件上存在差异，从而影响其生活力和存活率。鲤春病毒血症病毒（SVCV）是一种在水产养殖中具有严重经济影响的疾病，几乎只感染鲤科鱼类，主要是普通鲤鱼，并导致高死亡率，而银鲫则是较不易感的物种。

我们的研究聚焦于头肾的转录组谱分析，以揭示高易感鲤鱼、弱易感银鲫及杂交品系中的差异基因表达，假设差异基因表达模式将反映F1代中的杂交优势以及回交和F2代中的杂交衰退。我们预期母本与父本回交之间的差异基因表达差异与细胞-核协同适应破坏假说相一致。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。