NCBI GEO来源的GSE22229原始数据层
在本研究中,研究者招募了已报道的最大规模免疫耐受肾移植受者队列,这些受者在停止服用免疫抑制药物后仍维持移植物存活,并将该队列与移植肾功能稳定的受者进行比较

基本信息
资源简介
NCBI GEO来源的GSE22229原始数据层
GSE22229 Raw Data Layer from NCBI GEO 是一个面向泌尿生殖系统疾病领域(本站归类为“其他”)的公开数据集,托管于 synapse.org,其原始数据层来自 NCBI GEO。该数据集围绕肾移植免疫耐受这一临床问题构建:研究者招募了已报道的最大规模免疫耐受肾移植受者队列,这些受者在停止服用免疫抑制药物后仍能维持移植物存活,研究将该队列与移植肾功能稳定的受者进行比较。数据集整体服务于移植免疫耐受机制与临床表型差异的探索性研究,适合作为肾移植耐受相关转录组或原始数据再分析的起点。
【数据集背景】
肾移植是终末期肾病的重要治疗手段,但受者通常需要长期服用免疫抑制药物以预防排斥反应,而长期用药带来感染、药物毒性等风险。少数受者能够在撤除免疫抑制药物后仍维持移植物功能稳定,这类“免疫耐受”受者成为理解移植耐受机制的重要研究对象。该数据集所依托的研究正是围绕这一背景展开:研究者招募了已报道的最大规模免疫耐受肾移植受者队列,并将其与移植肾功能稳定的受者进行对照比较,以期从原始数据层面刻画耐受受者与稳定受者之间的差异。本站将其归入泌尿生殖系统疾病分类下的“其他”类别。
【数据内容】
该数据集为 NCBI GEO 来源的原始数据层(Raw Data Layer),即保留原始测量层面的数据集合,而非仅提供经过汇总或差异分析后的结果表。其核心样本构成包括免疫耐受肾移植受者队列与移植肾功能稳定的受者对照队列。关于具体的样本数量、检测平台、数据文件格式与字段结构,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO,并经 synapse.org 站点发布。研究设计为队列对照研究:招募已报道的最大规模的免疫耐受肾移植受者,这些受者在停止服用免疫抑制药物后仍维持移植物存活;对照为移植肾功能稳定的受者。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体的临床随访方案,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肾移植免疫耐受方向的探索性研究,例如:对耐受受者与稳定受者进行原始数据层面的再分析,识别与免疫耐受状态相关的分子特征;作为移植免疫耐受研究的公共数据资源,用于方法学比较或结果验证;也可为泌尿生殖系统疾病领域中移植相关研究提供数据支撑。需要强调的是,其适用性应限定在探索性与假设生成层面,具体分析结论需结合研究设计与临床信息判断。
【使用方法】
使用时应先明确该数据集为原始数据层,需按 NCBI GEO 原始数据的常规流程进行预处理与质量控制,再开展样本分组比较。分组应依据原始研究中对免疫耐受受者与移植肾功能稳定受者的界定进行。由于源站未提供平台与文件格式细节,具体处理步骤需参照数据文件自身说明。分析结果应结合临床背景解读,避免将分子差异直接等同于耐受机制。
【质量与限制】
该数据集的主要限制在于:其仅为原始数据层,缺少经过整理的分析结果;样本量、平台、临床变量与随访信息等关键属性源站未提供,因而难以独立评估数据完整性与偏倚风险;研究结论受原始队列设计约束,外推需谨慎。此外,本站分类为“其他”,提示其疾病分类归属较为宽泛。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI GEO 并经 synapse.org 发布,使用时应遵循源站的引用规范与数据使用条款。关于具体的许可类型、引用文献与访问限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://synapse.org/Synapse:syn256118
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在这项研究中,研究者招募了迄今为止报道的最大规模的耐受性肾移植受者队列,这些受者在停止服用免疫抑制药物后仍维持移植物存活,并将该队列与具有稳定同种异体移植物功能的受试者进行了比较。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




