大鼠模型胎儿肠梗阻后的基因表达

主题标签:基因表达、胎儿肠梗阻、大鼠模型、妊娠、分娩、产褥期。本站分类:妊娠、分娩和产褥期。本数据集为妊娠、分娩和产褥期领域公开数据集,主题涵盖基因表达。

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基因组分类基因表达胎儿肠梗阻大鼠模型妊娠分娩产褥期
Gene expression after fetal intestinal obstruction on rat model

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

大鼠模型胎儿肠梗阻后的基因表达

Gene expression after fetal intestinal obstruction on rat model 是一个公开的基因表达数据集,来源于 ebi.ac.uk(ArrayExpress 平台,实验编号 E-MTAB-5981),由 Bourthoumieu Sylvie 于 2017 年提交。该数据集以大鼠为模型,研究胎儿肠梗阻发生后的基因表达变化,主题标签涵盖基因表达、胎儿肠梗阻、大鼠模型以及妊娠、分娩和产褥期。在分类体系上,它被归入“妊娠、分娩和产褥期 / 其他”类别,属于该领域可公开获取的实验数据资源。整体而言,该数据集为研究胎儿期肠道梗阻相关分子机制提供了转录层面的实验记录,适合与妊娠期胎儿发育、肠道病理及基因表达调控相关的研究者参考使用。

【数据集背景】

胎儿肠梗阻是一类发生在胎儿期的肠道发育异常,涉及肠道的形态与功能改变。在分子层面,梗阻刺激可能引起肠组织基因表达谱的调整,进而影响肠道结构与成熟过程。该数据集正是围绕这一背景,在大鼠模型上考察胎儿肠梗阻后的基因表达情况,试图从转录水平刻画梗阻对胎儿肠道的影响。数据集所属的“妊娠、分娩和产褥期”分类,说明其研究情境与妊娠期胎儿健康密切相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括基因表达、胎儿肠梗阻、大鼠模型、妊娠、分娩和产褥期,核心内容是胎儿肠梗阻大鼠模型中的基因表达数据。数据集英文名称明确指向“Gene expression after fetal intestinal obstruction on rat model”,即在大鼠模型上观察胎儿肠梗阻之后的基因表达。除上述主题信息外,关于具体样本数量、检测平台、基因数量、分组设计等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,属于 ArrayExpress 平台收录的实验数据,实验编号为 E-MTAB-5981,提交者为 Bourthoumieu Sylvie,提交年份为 2017 年。源站描述给出的引用信息为:Bourthoumieu Sylvie (2017). Gene expression after fetal intestinal obstruction on rat model [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-5981/。关于实验动物品系、造模方法、样本采集流程与测序或芯片平台等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于妊娠、分娩和产褥期领域内与胎儿肠道发育和病理相关的基因表达研究,可用于探讨胎儿肠梗阻条件下转录谱的变化,也可作为大鼠模型中肠道梗阻分子机制研究的参考数据。对于关注胎儿期肠道疾病、妊娠期胎儿异常以及基因表达调控的研究者,该数据集具有潜在的比较与验证价值。由于主题标签同时包含基因表达与大鼠模型,它也可用于跨研究的数据整合或方法学参考。具体适用场景的边界,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ebi.ac.uk 的 ArrayExpress 平台以实验编号 E-MTAB-5981 提供访问,使用者可依据源站提供的实验页面获取数据。关于数据下载格式、预处理步骤、分析流程与推荐工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开收录的实验数据,来源站为 ebi.ac.uk,提交信息完整标注了提交者与年份。关于样本量、技术重复、数据质控指标、批次效应以及结果的可重复性等质量相关信息,源站未提供。使用者在引用和解释该数据集时,应结合源站页面进一步核实实验设计与数据细节。

【引用与许可】

引用该数据集时,建议采用源站给出的引用格式:Bourthoumieu Sylvie (2017). Gene expression after fetal intestinal obstruction on rat model [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-5981/。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-5981

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Bourthoumieu Sylvie (2017). Gene expression after fetal intestinal obstruction on rat model [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-5981/

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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