TCGA泛癌间充质转化吸引子
源站未提供该数据集的立项背景、研究团队、发布目的与项目阶段等信息。从名称与来源描述可以确认的是,它关联到 TCGA 泛癌项目,来源描述中该项目被标注为 syn362400

基本信息
资源简介
TCGA泛癌间充质转化吸引子
TCGA Pan Cancer Mesenchymal Transition Attractor(TCGA 泛癌间充质转化吸引子)在本站归类为“肿瘤 / 其他”,来源站为 synapse.org,内容聚焦于 TCGA 泛癌项目中间充质转化吸引子(Mesenchymal Transition Attractors,MES)的相关详细信息。
【数据集背景】
源站未提供该数据集的立项背景、研究团队、发布目的与项目阶段等信息。从名称与来源描述可以确认的是,它关联到 TCGA 泛癌项目,来源描述中该项目被标注为 syn362400。在肿瘤研究的通用语境下,泛癌(Pan Cancer)一般指跨多个癌种开展的整合性分析,而间充质转化(Mesenchymal Transition)是与肿瘤细胞状态改变相关的研究方向;这些属于领域内的通用概念,并非对该数据集具体属性的说明。
【数据内容】
依据来源描述,本数据集收录的是 TCGA 泛癌项目中发现的间充质转化吸引子(MES)的详细信息,并以 HTML 表格的形式对外呈现,用户可通过“Download”入口查看这些表格。至于表格包含哪些字段、覆盖多少癌种与样本、涉及哪些计算指标与数值范围、是否附有配套图表或注释文件,源站均未提供。因此,该数据集的具体内容维度需要以实际打开表格后所见的为准。
【采集与来源】
本数据集的来源站为 synapse.org。来源描述中给出了一个具体链接,指向 dl.dropbox.com 下 /u/11986954/panCancer/tcgaPanCancer.mes.html 这一页面。源站未提供样本采集方式、实验平台、数据处理步骤、所用算法与版本以及数据生成时间等信息,也未说明该页面与 synapse.org 上其他条目之间的具体关系。
【适用场景】
源站未提供关于该数据集适用场景的说明,未标注推荐用途或目标用户群体。来源描述仅说明了内容主题与查看方式,因此它是否适用于间充质转化相关分析、泛癌比较研究或其他用途,需要使用者结合自身研究目的自行判断。
【使用方法】
来源描述指出,点击“Download”即可查看 HTML 表格。除这一操作提示外,源站未提供关于下载文件格式、文件体积、是否需要注册或登录、是否附带说明文档或元数据表等进一步的使用指引。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估结果、数据完整性、准确性、更新频率、版本变更以及已知缺陷或使用限制的说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、文献出处、许可条款与使用限制信息,也未说明是否可以再分发或用于商业用途。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://synapse.org/Synapse:syn1446359
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
http://dl.dropbox.com/u/11986954/panCancer/tcgaPanCancer.mes.html 有关在 TCGA 泛癌项目(syn362400)中发现的间充质转化吸引子(MES)的详细信息。点击“下载”查看 HTML 表格。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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