TCGA泛癌间充质转化吸引子

源站未提供该数据集的立项背景、研究团队、发布目的与项目阶段等信息。从名称与来源描述可以确认的是,它关联到 TCGA 泛癌项目,来源描述中该项目被标注为 syn362400

synapse
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表格分类转录组基因表达表格数据多癌种上皮间质转化肿瘤转移状态分析标志物发现
TCGA Pan Cancer Mesenchymal Transition Attractor

基本信息

模态
表格
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

TCGA泛癌间充质转化吸引子

TCGA Pan Cancer Mesenchymal Transition Attractor(TCGA 泛癌间充质转化吸引子)在本站归类为“肿瘤 / 其他”,来源站为 synapse.org,内容聚焦于 TCGA 泛癌项目中间充质转化吸引子(Mesenchymal Transition Attractors,MES)的相关详细信息。

【数据集背景】

源站未提供该数据集的立项背景、研究团队、发布目的与项目阶段等信息。从名称与来源描述可以确认的是,它关联到 TCGA 泛癌项目,来源描述中该项目被标注为 syn362400。在肿瘤研究的通用语境下,泛癌(Pan Cancer)一般指跨多个癌种开展的整合性分析,而间充质转化(Mesenchymal Transition)是与肿瘤细胞状态改变相关的研究方向;这些属于领域内的通用概念,并非对该数据集具体属性的说明。

【数据内容】

依据来源描述,本数据集收录的是 TCGA 泛癌项目中发现的间充质转化吸引子(MES)的详细信息,并以 HTML 表格的形式对外呈现,用户可通过“Download”入口查看这些表格。至于表格包含哪些字段、覆盖多少癌种与样本、涉及哪些计算指标与数值范围、是否附有配套图表或注释文件,源站均未提供。因此,该数据集的具体内容维度需要以实际打开表格后所见的为准。

【采集与来源】

本数据集的来源站为 synapse.org。来源描述中给出了一个具体链接,指向 dl.dropbox.com 下 /u/11986954/panCancer/tcgaPanCancer.mes.html 这一页面。源站未提供样本采集方式、实验平台、数据处理步骤、所用算法与版本以及数据生成时间等信息,也未说明该页面与 synapse.org 上其他条目之间的具体关系。

【适用场景】

源站未提供关于该数据集适用场景的说明,未标注推荐用途或目标用户群体。来源描述仅说明了内容主题与查看方式,因此它是否适用于间充质转化相关分析、泛癌比较研究或其他用途,需要使用者结合自身研究目的自行判断。

【使用方法】

来源描述指出,点击“Download”即可查看 HTML 表格。除这一操作提示外,源站未提供关于下载文件格式、文件体积、是否需要注册或登录、是否附带说明文档或元数据表等进一步的使用指引。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估结果、数据完整性、准确性、更新频率、版本变更以及已知缺陷或使用限制的说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、文献出处、许可条款与使用限制信息,也未说明是否可以再分发或用于商业用途。

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使用方式

数据集获取

源站:https://synapse.org/Synapse:syn1446359

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

http://dl.dropbox.com/u/11986954/panCancer/tcgaPanCancer.mes.html 有关在 TCGA 泛癌项目(syn362400)中发现的间充质转化吸引子(MES)的详细信息。点击“下载”查看 HTML 表格。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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