基本信息

模态

基因组

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创建/更新时间

2026-10-01

资源简介

TCGA泛癌吸引子元基因

将吸引子发现算法（Attractor Finding Algorithm, syn1442695）应用于丰富的 TCGA 基因表达数据，可得到三个泛癌吸引子元基因和一个位于 chr8q24.3 的基因组定位吸引子元基因

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：将吸引子发现算法（Attractor Finding Algorithm, syn1442695）应用于丰富的 TCGA 基因表达数据，可得到三个泛癌吸引子元基因和一个位于 chr8q24.3 的基因组定位吸引子元基因。用于生成这三个吸引子的脚本见 syn1446308。用于生成该基因组定位吸引子的脚本见 syn1446673。

【主题与分类】

主题标签：基因表达、转录组、肿瘤、癌症基因组、吸引子识别、元基因挖掘、模式发现、泛癌分析。本站分类：肿瘤。

【获取与许可】

源站页面：https://synapse.org/Synapse:syn1446304

原始链接

https://synapse.org/Synapse:syn1446304

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源站：https://synapse.org/Synapse:syn1446304

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访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

将吸引子发现算法（Attractor Finding Algorithm, syn1442695）应用于丰富的 TCGA 基因表达数据，可得到三个泛癌吸引子元基因和一个位于 chr8q24.3 的基因组定位吸引子元基因。用于生成这三个吸引子的脚本见 syn1446308。用于生成该基因组定位吸引子的脚本见 syn1446673。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别