肾移植受者巨细胞病毒活动性感染诊断检测评估

该数据集来自单中心前瞻性队列研究,纳入30例连续肾移植受者,移植后第15天至第6个月采集外周血样本,采用pp65抗原血症和定量PCR两种方法检测CMV复制,共分析240份样本,比较两种方法诊断CMV活动性感染的发生率并建立临床-实验室相关性

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2023-06-07 更新
浏览 8
图像分类cytomegalovirusimmunohistochemistrykidney transplantationpolymerase chain reaction
Evaluation of diagnostic tests for cytomegalovirus active infection in renal transplant recipients

基本信息

模态
图像
大小
0.001304706 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-07
版本
v1

资源简介

肾移植受者巨细胞病毒活动性感染诊断检测评估

Evaluation of diagnostic tests for cytomegalovirus active infection in renal transplant recipients

该数据集来自单中心前瞻性队列研究,纳入30例连续肾移植受者,移植后第15天至第6个月采集外周血样本,采用pp65抗原血症和定量PCR两种方法检测CMV复制,共分析240份样本,比较两种方法诊断CMV活动性感染的发生率并建立临床-实验室相关性。数据以6个图像文件形式提供,可用于CMV感染诊断方法比较、肾移植术后感染监测及临床检验相关研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Evaluation of diagnostic tests for cytomegalovirus active infection in renal

transplant recipients》发表于 Jornal Brasileiro de Nefrologia(2017),DOI:10.5935/0101-2800.20170008。源站首次发布:2022-06-02。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):摘要 引言:巨细胞病毒(CMV)感染是肾移植术后主要的病毒感染。目前采用的诊断方法为pp65抗原血症和聚合酶链反应(PCR)核酸扩增,旨在检测病毒复制。目的:本研究旨在通过两种方法评估和比较肾移植患者CMV活动性感染的发生率,并建立最佳的临床-实验室相关性。方法:30例连续肾移植受者被纳入一项单中心前瞻性队列研究。从移植后第15天至第6个月采集外周血样本,通过pp65抗原血症和定量PCR(qPCR)检测CMV复制。结果:共分析240份样本,两种方法检测的活动性感染发生率相似。时间……

【数据结构与技术规格】

文件数 6 个,合计 1.30 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.19964012.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Nephrology and Urology。主题标签:cytomegalovirus、immunohistochemistry、kidney transplantation、polymerase chain reaction。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Nephrology and Urology。

【获取与许可】

源站页面:https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Evaluation_of_diagnostic_tests_for_cytomegalovirus_active_infection_in_renal_transplant_recipients/19964012

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Franco, Rodrigo Fontanive; Montenegro, Rosangela Munhoz; Machado, Alice Beatriz Mombach Pinheiro; Paris, Fernanda de; Menezes, Denise Silva; Manfro, Roberto Ceratti (2017). Evaluation of diagnostic tests for cytomegalovirus active infection in renal transplant recipients. SciELO journals. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-07,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.3 MB。

数据说明

摘要 引言:巨细胞病毒(CMV)感染是肾移植术后主要的病毒感染。目前采用的诊断方法为pp65抗原血症检测和聚合酶链反应(PCR)核酸扩增,旨在检测病毒复制。目的:本研究旨在通过两种方法评估和比较肾移植患者中CMV活动性感染的发生率,并建立最佳的临床-实验室相关性。方法:30例连续肾移植受者被纳入一项单中心前瞻性队列研究。从移植后第15天至第6个月采集外周血样本,并通过pp65抗原血症检测和定量PCR(qPCR) assay检测CMV复制。结果:共分析240份样本,两种方法检测的活动性感染发生率相似。首次阳性检测所需时间几乎相同,但qPCR检测阳性的样本多于抗原血症检测,其表现随时间几乎均匀分布。

217份样本(90.4%;kappa=0.529;p<0.001)和25例患者(83.3%;kappa=0.667;p<0.001)中观察到检测结果一致。对CMV复制的诊断参数评估显示,qPCR检测的敏感性(82.1%)高于抗原血症检测(59.0%)。定量PCR的准确性也略高于抗原血症检测。结论:我们的数据表明,两种方法均适用于检测移植后巨细胞病毒复制,且准确性几乎相当。选择何种检测方法需考虑各机构的需求、执行能力和成本效益。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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