产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌感染肾移植患者数据

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含 1 个 Excel 文件,涉及肾移植患者移植前后 CD4 与 CD8 T 细胞表型分析,关注免疫抑制(如 ATG 诱导)对免疫成熟、衰老及感染风险的影响,并探讨 TIM3 与 TIGIT 表达 CD4 T 细胞与感染风险的关联

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2025-05-22 更新
浏览 9
蛋白质预测T cellimmunosuppressionantithymocyte globulinkidney transplantationinfection
Data from: Infection related to Klebsiella pneumoniae producing carbapenemase in renal transplant patients

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000011637 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-05-22
版本
v1

资源简介

产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌感染肾移植患者数据

Data Sheet 2_TIM3 and TIGIT-expressing CD4 T cells are impacted by kidney transplantation and associated with risk of infection.xlsx

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含 1 个 Excel 文件,涉及肾移植患者移植前后 CD4 与 CD8 T 细胞表型分析,关注免疫抑制(如 ATG 诱导)对免疫成熟、衰老及感染风险的影响,并探讨 TIM3 与 TIGIT 表达 CD4 T 细胞与感染风险的关联。数据可用于研究肾移植后免疫状态变化与感染预测(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Kinetics of peripheral blood lymphocyte subpopulations predicts the occurrence of opportunistic infection after kidney transplantation》发表于 Transplant International(2014),DOI:10.1111/tri.12321。源站首次发布:2025-05-22。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):引言:老年肾移植患者感染率高于年轻移植患者,提示年龄相关免疫功能障碍的影响。然而,关于免疫抑制包括抗胸腺细胞球蛋白(ATG)诱导的影响,以及 T 细胞亚型能否预测感染风险,所知甚少。方法:我们采集了 91 例患者在肾移植前及移植后 3 个月的血液,分析 CD4 和 CD8 T 细胞表型,以确定免疫抑制对免疫成熟、衰老和感染的影响。结果:移植后 naïve T 细胞数量总体下降,而表达 TIM3 的 naïve 和中央记忆(CM)CD4 T 细胞频率增加,接受 ATG 的患者比接受 basiliximab 诱导的患者变化更显著。移植还导致 TI 频率增加

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 11.64 KB。数据集 DOI:10.3389/fimmu.2025.1550154.s002。

【主题与分类】

源站学科分类:Genetic Immunology。主题标签:T cell、immunosuppression、antithymocyte globulin、kidney transplantation、infection。本站分类:呼吸系统疾病/肺炎。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Genetic Immunology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_2_TIM3_and_TIGIT-expressing_CD4_T_cells_are_impacted_by_kidney_transplantation_and_associated_with_risk_of_infection_xlsx/29124803

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Pickering, Harry; Sen, Subha; Cappelletti, Monica; Lum, Erik L.; Bunnapradist, Suphamai; Reed, Elaine F.; et al. (2025). Data Sheet 2_TIM3 and TIGIT-expressing CD4 T cells are impacted by kidney transplantation and associated with risk of infection.xlsx. Frontiers. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Data Sheet 2_TIM3 and TIGIT-expressing CD4 T cells are impacted by kidney transplantation and associated with risk of infection.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/54725375"

文件清单

  • Data Sheet 2_TIM3 and TIGIT-expressing CD4 T cells are impacted by kidney transplantation and associated with risk of infection.xlsx(11.64 KB)

文件总体积 11.64 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

引言老年肾移植患者相比年轻移植患者感染率更高,提示年龄相关免疫功能障碍的影响。然而,关于包括抗胸腺细胞球蛋白(ATG)诱导在内的免疫抑制方案的影响,以及T细胞亚型能否预测感染风险,目前知之甚少。方法我们采集了91例患者在肾移植前及移植后3个月的血液样本,分析CD4和CD8 T细胞表型,以确定免疫抑制对免疫成熟、衰老及感染的影响。结果移植后,初始T细胞数量总体下降,而表达TIM3的初始和中央记忆(CM)CD4 T细胞频率增加,接受ATG诱导的患者相比巴利昔单抗诱导的患者变化更为显著。移植还导致表达TIGIT的效应记忆(EM)CD4 T细胞以及表达TIGIT和KLRG1的衰老CD8 T细胞频率增加。

naïve CD4和CD8 T细胞频率降低(分别为p=0.016和p=0.038)以及CD4 CM和EM TIGIT+ T细胞频率升高(p=0.022)与感染的发生相关。一个纳入CD4 EM TIGIT+ T细胞频率升高和ATG诱导的模型可预测肾移植后感染的发生(HR 3.73,CI 1.08-12.9)。讨论:与T细胞经历和衰老相关的TIM3和TIGIT标志物频率升高是与移植及诱导和维持免疫抑制相关的显著表型变化。将TIGIT表达和诱导类型纳入感染预测模型,有望用于风险分层和免疫抑制的个体化,以降低不良结局风险,尤其是对老年患者。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fimmu.2025.1550154.s002(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_2_TIM3_and_TIGIT-expressing_CD4_T_cells_are_impacted_by_kidney_transplantation_and_associated_with_risk_of_infection_xlsx/29124803)。

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