先天反应基因激活与真菌细菌感染、肺间质中性粒细胞及翼组织真菌菌丝和细菌评分的相关性
数据记录了各处理组蝙蝠细胞因子转录本 ΔCt 水平与肺间质中性粒细胞评分、5 个翼切片的平均细菌评分和真菌菌丝评分之间的 Pearson 相关系数,并标注了具有可用 Ct 值的样本数及不显著结果

基本信息
资源简介
先天反应基因激活与真菌细菌感染、肺间质中性粒细胞及翼组织真菌菌丝和细菌评分的相关性
Correlation of activation of innate response genes with fungal and bacterial infection, and neutrophils in the lung interstitium, and fungal hyphae and bacterial scores in wing tissues.
该数据集来自 plos.figshare.com,包含 1 个文件 Table_2.xls,对应 2014 年发表于 PLoS ONE 的小棕蝠(Myotis lucifugus)先天免疫反应基因激活研究。数据记录了各处理组蝙蝠细胞因子转录本 ΔCt 水平与肺间质中性粒细胞评分、5 个翼切片的平均细菌评分和真菌菌丝评分之间的 Pearson 相关系数,并标注了具有可用 Ct 值的样本数及不显著结果。该数据可用于分析先天免疫基因表达与真菌、细菌感染及组织病理评分之间的关联,服务于白鼻综合征等蝙蝠疾病研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《Activation of Innate Immune-Response Genes in Little Brown Bats (Myotis lucifugus) Infected with the Fungus Pseudogymnoascus destructans》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0112285。源站首次发布:2014-11-12。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对每个处理组蝙蝠的细胞因子转录本 ΔCt 水平与肺间质中性粒细胞评分以及每只蝙蝠 5 个翼切片的平均细菌评分和真菌菌丝评分计算了 Pearson 系数。N = 具有可用 Ct 值的样本数。NS = 不显著。先天反应基因激活与真菌和细菌感染、肺间质中性粒细胞以及翼组织真菌菌丝和细菌评分的相关性。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 9.73 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0112285.t002。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:fungus Pseudogymnoascus destructans、White Nose Syndrome、Little Brown Bats、infection、hibernating bats、modulators tumor necrosis factor、rna、response。本站分类:呼吸系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Correlation_of_activation_of_innate_response_genes_with_fungal_and_bacterial_infection_and_neutrophils_in_the_lung_interstitium_and_fungal_hyphae_and_bacterial_scores_in_wing_tissues_/1237909
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Rapin, Noreen; Johns, Kirk; Martin, Lauren; Warnecke, Lisa; M. Turner, James; K. Bollinger, Trent; et al. (2015). Correlation of activation of innate response genes with fungal and bacterial infection, and neutrophils in the lung interstitium, and fungal hyphae and bacterial scores in wing tissues..…
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
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数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Correlation of activation of innate response genes with fungal and bacterial infection, and neutrophils in the lung interstitium, and fungal hyphae and bacterial scores in wing tissues.
- DOI:10.1371/journal.pone.0112285.t002
- 发布日期:2014-11-12
- 文件数:1 个
- 文件总体积:9.73 KB
- 源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Correlation_of_activation_of_innate_response_genes_with_fungal_and_bacterial_infection_and_neutrophils_in_the_lung_interstitium_and_fungal_hyphae_and_bacterial_scores_in_wing_tissues_/1237909
命令行下载
curl -L -o "Table_2.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/1789833"
文件清单
Table_2.xls(9.73 KB)
文件总体积 9.73 KB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
针对每个处理组中蝙蝠细胞因子转录本的ΔCt水平,以及每只蝙蝠肺间质中性粒细胞评分和5个翼切片的平均细菌及菌丝评分,计算了Pearson相关系数。
N = 具有可用Ct值的样本数。NS = 不显著。
先天反应基因激活与真菌和细菌感染、肺间质中性粒细胞以及翼组织中真菌菌丝和细菌评分的相关性。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0112285.t002(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Correlation_of_activation_of_innate_response_genes_with_fungal_and_bacterial_infection_and_neutrophils_in_the_lung_interstitium_and_fungal_hyphae_and_bacterial_scores_in_wing_tissues_/1237909)。
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