肾病综合征患者肾组织A-to-I RNA编辑的edQTL与cledQTL汇总统计

该存储库包含GLOM和TUBE edQTL及cledQTL定位的汇总统计数据。主题标签:肾病综合征、肾组织、RNA编辑、edQTL、cledQTL、汇总统计、泌尿生殖系统疾病

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2026-10-19 更新
浏览 6
基因组肾病综合征肾组织RNA编辑edQTLcledQTL汇总统计泌尿生殖系统疾病
edQTL and cledQTL summary statistics for:  A-to-I RNA editing in kidney tissue from patients with nephrotic syndrome

基本信息

模态
基因组
大小
0.318808993 GB
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

肾病综合征患者肾组织A-to-I RNA编辑的edQTL与cledQTL汇总统计

该数据集为肾病综合征患者肾组织中A-to-I RNA编辑的edQTL与cledQTL汇总统计数据,英文全称为“edQTL and cledQTL summary statistics for: A-to-I RNA editing in kidney tissue from patients with nephrotic syndrome”。数据由Mezger, Victoria、McNulty, Michelle、Lee, Dongwon与Sampson, Matthew共同完成,存放于Zenodo机构平台,发布时间为2026年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议开放共享。数据集聚焦泌尿生殖系统疾病领域,主题涵盖肾病综合征、肾组织、RNA编辑、edQTL、cledQTL及汇总统计等方向,为相关遗传调控研究提供可复用的统计结果资源。

【数据集背景】

肾病综合征是一类以大量蛋白尿、低蛋白血症等为特征的肾脏疾病,其发病机制涉及遗传调控与转录后修饰等多层因素。A-to-I RNA编辑是转录后水平的重要调控方式,能够改变RNA序列并影响基因表达与功能。该数据集围绕肾病综合征患者肾组织中的A-to-I RNA编辑展开,旨在提供edQTL(RNA编辑数量性状位点)与cledQTL(可能指细胞类型水平或特定聚类水平的编辑数量性状位点)定位的汇总统计结果,支撑肾组织中RNA编辑遗传调控机制的研究。

【数据内容】

该存储库包含GLOM(肾小球)和TUBE(肾小管)两类组织的edQTL及cledQTL定位汇总统计数据。汇总统计通常指经过关联分析后得到的位点—编辑位点关系结果,可供下游研究者进行重分析、荟萃分析或与自身数据整合。数据集主题标签包括肾病综合征、肾组织、RNA编辑、edQTL、cledQTL、汇总统计以及泌尿生殖系统疾病,体现了其在肾脏疾病遗传调控研究中的定位。关于具体样本量、编辑位点数目、QTL数量及统计指标等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于doi.org对应的源站,标题与数据集英文名一致,存储于Zenodo平台。源站描述说明该存储库包含GLOM和TUBE的edQTL与cledQTL定位汇总统计。数据作者为Mezger, Victoria、McNulty, Michelle、Lee, Dongwon与Sampson, Matthew。关于样本采集流程、测序平台、数据处理管线及统计模型等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肾组织RNA编辑遗传调控研究,包括对GLOM与TUBE edQTL及cledQTL结果的验证、重分析或与其它肾脏疾病数据集的整合分析;也可用于探索肾病综合征相关RNA编辑位点的遗传基础,以及作为方法学比较中的参考统计结果。由于提供的是汇总统计而非原始测序数据,其适用性主要集中于关联结果的二次利用层面。

【使用方法】

使用者可通过doi.org定位源站并获取存储于Zenodo的汇总统计文件,依据Creative Commons Attribution 4.0 International许可进行使用与再分发。使用时应结合GLOM与TUBE的组织区分,分别处理edQTL与cledQTL结果。关于文件格式、字段含义、基因组版本及具体读取方式,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为汇总统计层面资源,不包含原始测序数据,因而无法直接用于重新进行QTL定位或编辑水平定量。其质量评估依赖于源站提供的处理流程说明,而该方面信息源站未提供。此外,数据仅覆盖GLOM与TUBE两类肾组织区域,外推至其他组织或人群时需谨慎。关于样本量、统计显著性阈值及批次效应等信息,源站未提供。

【引用与许可】

使用该数据集时应引用作者Mezger, Victoria、McNulty, Michelle、Lee, Dongwon与Sampson, Matthew的相关工作,并注明数据存放于Zenodo、发布时间为2026年。许可协议为Creative Commons Attribution 4.0 International,允许在署名前提下共享与改编。关于具体引用格式与DOI标识,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.23482262

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 318.8 MB。

数据说明

该存储库包含GLOM和TUBE edQTL及cledQTL定位的汇总统计数据。

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