冷水鱼(Salmo trutta)对新发病原体与温度联合效应的生态进化响应

该数据集来自 search.dataone.org,包含野生褐鳟(Salmo trutta)种群在自然水温梯度和 Tetracapsuloides bryosalmonae 感染率梯度下的遗传、表型、种群统计与环境数据

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基因组分类Climate changePKDsalmonidsEmerging infectious diseasesEvolutionary genetics
Eco-evolutionary responses of a cold-water fish (Salmo trutta) to the combined effects of an emerging pathogen and temperature

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

冷水鱼(Salmo trutta)对新发病原体与温度联合效应的生态进化响应

Eco-evolutionary responses of a cold-water fish (Salmo trutta) to the combined effects of an emerging pathogen and temperature

该数据集来自 search.dataone.org,包含野生褐鳟(Salmo trutta)种群在自然水温梯度和 Tetracapsuloides bryosalmonae 感染率梯度下的遗传、表型、种群统计与环境数据。内容涵盖单核苷酸多态性(SNPs)、免疫相关基因 MHC-DAB 的基因型、个体体况与类胡萝卜素着色指标,以及种群密度、感染率和水温记录,采样覆盖季节性疾病暴发前后。可用于研究病原压力与热应激如何影响遗传和表型变异,并区分表型可塑性与生存选择的作用(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含沿自然水温梯度和 Tetracapsuloides bryosalmonae(引起增殖性肾病 PKD 的寄生虫)感染率梯度采样的野生褐鳟(Salmo trutta)种群的遗传、表型、种群统计和环境数据。它包括单核苷酸多态性(SNPs)、免疫相关基因(MHC-DAB)的基因型、个体水平的体况和基于类胡萝卜素的着色指标,以及种群密度、感染率和水温记录。采样在季节性疾病暴发前后均进行,从而支持时间比较。该数据集用于研究病原压力和热应激如何影响遗传和表型变异,并区分表型可塑性和生存选择在野生种群中的作用。该资源 i

【主题与分类】

主题标签:Climate change、PKD、salmonids、Emerging infectious diseases、Evolutionary genetics。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ab639412a75089255bbc45d3ee773a1b098993061ded67beba52fae67af5855b1

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数据说明

该数据集包含野生褐鳟(Salmo trutta)种群的遗传、表型、人口统计和环境数据,这些种群沿水温自然梯度以及由Tetracapsuloides bryosalmonae(导致增殖性肾病(PKD)的寄生虫)感染流行率梯度采样获得。数据集包括单核苷酸多态性(SNPs)、免疫相关基因(MHC-DAB)的基因型、个体水平的体况和基于类胡萝卜素的体色指标,以及种群密度、感染流行率和水温记录。采样在季节性病害暴发前后均进行,从而能够进行时间比较。该数据集用于研究病原体压力和水温胁迫如何影响遗传和表型变异,并厘清表型可塑性和生存力选择在野生种群中的作用。

该资源适用于生态-进化动力学、宿主-病原体相互作用以及气候……等研究的重复使用,,,# Dryad 数据集 数据集 DOI:10.5061/dryad.47d7wm3s5 ## 数据和文件结构说明 “Duvaletal2025_MHC_858ind.txt” 和 “Duvaletal2025_SNPs_141loci.txt” 分别包含来自补充表 S1 和 S2 所述 15 个种群的 858 尾褐鳟个体的 MHC 和 SNP 基因型。 “Duvaletal2025_model_pop_parameters.txt” 包含该研究中统计分析所使用的环境、形态和遗传变量。 ### 文件和变量 #### 文件:Duvaletal2025_CMH_858ind.txt 说明: ##### 变量 * code:种群 × 采样场次编号 * Pop:种群名称 * Ind:个体名称 * DAB:MHC-DAB 基因型 * MHC1:单倍型 1 * MHC2:单倍型 2 #### 文件:Duvaletal2025_SNPs_141loci.txt 说明: ##### 变量 * Pop:种群名称 * Ind:个体名称 * 每个位点的 SNP 基因型 #### 文件:Duvaletal2025_model_pop_parameters.txt 说明: ##### 变量 * Pop:种群名称……

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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