新生儿筛查检测方法开发:Angelman 综合征与 Prader-Willi 综合征
该数据集来自 clinicaltrials.gov,围绕 Angelman 综合征与 Prader-Willi 综合征的新生儿筛查检测方法开发展开

基本信息
资源简介
新生儿筛查检测方法开发:Angelman 综合征与 Prader-Willi 综合征
该数据集来自 clinicaltrials.gov,围绕 Angelman 综合征与 Prader-Willi 综合征的新生儿筛查检测方法开发展开。项目分为检测开发与检测验证两个阶段:开发阶段利用常规新生儿筛查重症联合免疫缺陷和脊髓性肌萎缩症后剩余的匿名干血斑 DNA,通过甲基化特异性 PCR 结合熔解曲线分析评估 15 号染色体 q11-q13 区域 SNRPN 启动子甲基化状态;验证阶段计划使用各组干血斑提取的 DNA 样本评估检测的敏感性与特异性。可用于新生儿筛查检测方法的开发与性能评价研究(来源 clinicaltrials.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):条件:Angelman 综合征、Prader-Willi 综合征。本项目将包含检测开发阶段和检测验证阶段。在检测开发阶段,研究者将开发一种评估 SNRPN 启动子(位于 15 号染色体 q11-q13)甲基化状态的方法,使用甲基化特异性 PCR 结合熔解曲线分析,样本为来自常规新生儿筛查重症联合免疫缺陷和脊髓性肌萎缩症后剩余的匿名干血斑 DNA。在检测验证阶段,研究者计划使用从以下各组干血斑中提取的一组 DNA 样本评估该检测的敏感性和特异性:1. 健康个体 2. 经基因检测确认 15 号染色体 q11-q13 母源拷贝缺失,或存在两个 15 号染色体 q11-q13 父源拷贝或印记
【主题与分类】
主题标签:Angelman Syndrome、Prader-Willi Syndrome。本站分类:妊娠、分娩和产褥期。
【获取与许可】
源站页面:https://clinicaltrials.gov/study/NCT05783791
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源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT05783791
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
条件:Angelman综合征、Prader-Willi综合征。本项目将分为检测方法开发阶段和检测方法验证阶段。在检测方法开发阶段,研究人员将开发一种评估SNRPN启动子(位于染色体15q11-q13)甲基化状态的方法,该方法采用甲基化特异性PCR结合熔解曲线分析,使用来自常规新生儿筛查干血样本中用于严重联合免疫缺陷和脊髓性肌萎缩症检测的去标识化剩余DNA。在检测方法验证阶段,研究人员计划使用从干血斑中提取的DNA样本,在以下各组中评估该检测方法的灵敏度和特异性:1. 健康个体 2. 经基因检测确认母源染色体15q11-q13拷贝缺失,或存在两个父源染色体15q11-q13拷贝或印记中心缺陷的AS患者。3. 经基因检测确认父源染色体15q11-q13拷贝缺失,或存在两个母源染色体15q11-q13拷贝或印记中心缺陷的PWS患者。
对于AS或PWS的参与者,将在其家中通过自我操作的手指刺破方式采集血样。参与者将使用提供的信封将样本邮寄给研究人员。如果研究团队在两次电话尝试后仍无法联系到参与者,研究团队可以在其下次门诊就诊时接触他们,以评估其参与研究的兴趣。如果参与者在这次门诊就诊时选择加入研究,可以在诊所采集血样。对于健康对照组,将通过自我操作的手指刺破方式采集血样,并且参与者将口头回答一份简短的人口统计问卷。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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