密度至关重要:家鼠种群动态如何揭示Leptospira流行病学特征

该数据集来自search.dataone.org,围绕家鼠(Mus musculus)与Leptospira的捕获-标记-重捕-采样研究,于2016至2018年在两个站点开展重复纵向调查,春秋两季进行捕获-标记-重捕并采集血样与肾样

dataone
浏览 11
表格回归Leptospira borgpetersenii serovar Ballumwildlife disease surveillancehybrid mixture modelnegative density-dependenceabundanceMicromammalsDisease ecology
Density matters: How population dynamics of house mice (Mus musculus) inform the epidemiology of Leptospira

基本信息

模态
表格
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

密度至关重要:家鼠种群动态如何揭示Leptospira流行病学特征

Density matters: How population dynamics of house mice (Mus musculus) inform the epidemiology of Leptospira

该数据集来自search.dataone.org,围绕家鼠(Mus musculus)与Leptospira的捕获-标记-重捕-采样研究,于2016至2018年在两个站点开展重复纵向调查,春秋两季进行捕获-标记-重捕并采集血样与肾样。数据可用于估计鼠密度与活动区域、比较Leptospira阳性与阴性个体差异,并分析暴露与排菌状态,服务于野生动物疾病监测与疾病生态学研究(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):啮齿动物是多种病原体的维持宿主,其密度和病原体流行率共同决定它们对其他动物或人类构成的风险。然而,密度常常被忽视。我们研究了一种捕获-标记-重捕-采样策略,以引入的家鼠(Mus musculus)和Leptospira为模型,展示联合方法的优势。我们在2016年至2018年间开展的一项重复纵向调查中估计了小鼠的种群密度和Leptospira流行率。在两个站点于春季和秋季进行捕获-标记-重捕环节,并在每个环节结束时采集血液和肾脏样本。小鼠密度和活动区域使用空间显式捕获-重捕(SECR)模型估计,并在Leptospira阳性与阴性小鼠之间进行比较。Leptospira暴露和排菌状态被估计

【主题与分类】

主题标签:Leptospira borgpetersenii serovar Ballum、wildlife disease surveillance、hybrid mixture model、negative density-dependence、abundance、Micromammals、Disease ecology。本站分类:泌尿生殖系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ad491a3951d5807bb9ba579c02e158188d801b3b3311ac7e2d803698082a358e7

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ad491a3951d5807bb9ba579c02e158188d801b3b3311ac7e2d803698082a358e7

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

啮齿动物是多种病原体的维持宿主,其密度和病原体流行率共同决定了它们对其他动物或人类构成的风险。然而,密度往往被忽视。我们以入侵小鼠(Mus musculus)和钩端螺旋体为模型,研究了捕获-标记-重捕-采样策略,并展示了联合方法的优势。我们在2016年至2018年开展的一项重复纵向调查中,估计了小鼠的种群密度和钩端螺旋体流行率。在春季和秋季于两个地点进行了捕获-标记-重捕环节,并在每个环节结束时采集了血液和肾脏样本。小鼠密度和活动区域采用空间显式捕获-重捕(SECR)模型进行估计,并比较了钩端螺旋体阳性与阴性小鼠之间的差异。钩端螺旋体暴露和排菌状态通过显微镜凝集试验以及肾脏培养和lipL32 PCR联合检测进行估计。钩端螺旋体……本数据通过捕获-标记-重捕和细菌学方法获得。

2016年春季至2018年秋季期间,使用两个各含36个Longworth小型哺乳动物活捕器的网格进行了四次活捕,每次活捕包含两个阶段。在捕获-标记-重捕(CMR)阶段(前五晚),捕获小鼠(Mus musculus),进行耳标标记、性别鉴定、称重并释放。在随后的移除阶段,还对小鼠进行采血、安乐死,并检测其肾脏的钩端螺旋体感染。使用显微凝集试验(MAT)检测针对钩端螺旋体属(Leptospira spp.)特别是L. borgpetersenii血清型Ballum的抗体,并通过培养和实时PCR确定肾脏中钩端螺旋体属的存在。, , # 密度至关重要:家鼠(Mus musculus)的种群动态如何为Leptospira的流行病学提供信息 https://doi.org/10.5061/dryad.x69p8czsq ## d的描述

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。