多囊肾病囊肿微环境空间转录组数据
该数据集来自 zenodo.org，为多囊肾病囊肿微环境的空间转录组 AnnData 对象（spatial_processed.h5ad），包含 8,149 个 spot 和 17,628 个基因，整合了基因表达、空间坐标与图像元数据
基本信息
资源简介
多囊肾病囊肿微环境空间转录组数据
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
该数据集来自 zenodo.org，为多囊肾病囊肿微环境的空间转录组 AnnData 对象（spatial_processed.h5ad），包含 8,149 个 spot 和 17,628 个基因，整合了基因表达、空间坐标与图像元数据。观测层涵盖 spot 级空间坐标、组织归属、文库标识、线粒体/血红蛋白/核糖体含量等质控指标、细胞周期评分、聚类分配与细胞类型注释；变量层提供基因信息、基因组注释、特征类别及每基因质控指标；非结构化数据保存聚类结果、PCA/UMAP 参数、颜色映射与组织图像。该数据可作为下游分析输入，用于研究损伤细胞、特征基因及细胞通讯模式（来源 Zenodo，cc-by-4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2025-10-06。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集包含一个空间转录组 AnnData 对象（spatial_processed.h5ad），具有 8,149 个 spot 和 17,628 个基因，整合了基因表达、空间坐标和图像元数据。该数据集被用作相关出版物中所有下游分析的输入。观测（.obs）：spot 级元数据，包括空间坐标（array_row、array_col）、组织归属（in_tissue）、文库标识符、质量控制指标（线粒体、血红蛋白、核糖体含量）、细胞周期评分、聚类分配和细胞类型注释。变量（.var）：基因信息、基因组注释、特征类别以及每基因质控指标（计数、丢失率、变异性统计）。非结构化数据（.uns）：分析元数据，包括聚类结果、PCA/UMAP 参数、颜色映射以及存储组织图像的空间字段（
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 2.01 GB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.17279214。
【主题与分类】
主题标签：Spatial Transcriptomics。本站分类：泌尿生殖系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/17279214
使用许可：cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-10-13，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.17279214
（注册/登录后按页面指引下载）
数据集大小约 2.01 GB。
数据说明
Claudio Novella-Rausell; Claudio Novella-Rausell; Sevtap Aysu Yasinoglu; Sevtap Aysu Yasinoglu (2025). Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease [Dataset]. http://doi.org/10.5281/zenodo.17279214
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