SCAPeSCLC：整合临床数据、生存结局与贝叶斯通路活性的广泛期小细胞肺癌多层级转录组协调资源-38714
SCAPeSCLC整合GEO GSE261345和GSE261348，是广泛期小细胞肺癌多层级转录组与临床资源，统一感兴趣区域及患者水平分子谱、临床注释、生存结局、贝叶斯通路活性与生存分析
基本信息
资源简介
SCAPeSCLC：整合临床数据、生存结局与贝叶斯通路活性的广泛期小细胞肺癌多层级转录组协调资源
SCAPeSCLC: A Harmonized Multi-Level Transcriptomic Resource for Extensive-Stage Small Cell Lung Cancer Integrating Clinical Data, Survival Outcomes, and Bayesian Pathway Activity
SCAPeSCLC整合GEO GSE261345和GSE261348，是广泛期小细胞肺癌多层级转录组与临床资源，统一感兴趣区域及患者水平分子谱、临床注释、生存结局、贝叶斯通路活性与生存分析。GSE261345为26例durvalumab联合铂-依托泊苷队列，GSE261348为32例atezolizumab联合铂-依托泊苷队列，均接受一线PD-L1抑制剂化疗免疫治疗。表达提供log₂标准化与Z-score格式，生存含PFS、DSS、OS。标本采集于治疗前，表达为治疗前谱，生存为治疗后结局，须结合治疗背景解读（来源 DOI 解析，Creative Commons Attribution 4.0 International 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：SCAPeSCLC 数据集是一个协调统一的多层次转录组学和临床资源，源自公开可用的 Gene Expression Omnibus (GEO) 数据集 GSE261345 和 GSE261348。它整合了感兴趣区域（ROI）水平和患者水平的分子谱，以及标准化临床注释、生存结局、贝叶斯通路活性估计和全面的生存分析输出，构成一个用于广泛期小细胞肺癌（ES-SCLC）的统一分析框架，并纳入接受一线 PD-L1 抑制剂为基础化疗免疫治疗患者的治疗前空间转录组学图谱和后续临床结局。源数据集及相关临床研究在本记录随附的元数据中引用。源队列包括两项 ES-SCLC 一线化疗免疫治疗临床试验：GSE261345 代表 CANTABRICO 队列，包括 26 例接受 durvalumab 联合铂类–依托泊苷化疗的患者。GSE261348 代表 IMfirst 队列，包括 32 例接受 atezolizumab 联合铂类–依托泊苷化疗的患者。因此，两个队列均代表接受以 PD-L1 抑制剂为基础的一线化疗免疫治疗的患者。本数据集通过将源数据协调统一并重构为统一分析框架而构建。生成了 ROI 水平和患者水平的基因表达矩阵，并同时提供标准化临床注释、生存结局和衍生分析变量。基因表达值以 log₂ 标准化和 Z 分数缩放两种格式提供。生存数据包括无进展生存（PFS）、疾病特异性生存（DSS）和总生存（OS）的事件发生时间区间和事件指示符，从而支持下游预后建模。重要的是，转录组测量所依据的肿瘤标本是在全身治疗开始前采集的。因此，基因表达数据代表治疗前分子谱，而随附的 PFS、DSS 和 OS 指标代表治疗后观察到的临床结局。因此，这些生存终点应在研究队列所接受的一线化疗免疫治疗的背景下解释，不应被视为独立于治疗的初治临床结局。除基因水平数据外，cura
【主题与分类】
主题标签：SCLC、ES-SCLC、Small Cell Lung Carcinoma、Small Cell Lung Carcinoma/mortality、Cancer Transcriptome Atlas、Spatial Transcriptomics、NanoString GeoMx DSP、Bayesian statistics、Bayes Theorem、Biostatistics。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.20648780
使用许可：Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 36.7 MB。
数据说明
SCAPeSCLC数据集是一个协调统一的多层级转录组与临床资源，来源于公开可获取的基因表达综合数据库（GEO）数据集GSE261345和GSE261348。该数据集将感兴趣区域（ROI）水平和患者水平的分子谱与标准化临床注释、生存结局、贝叶斯通路活性估计以及全面的生存分析输出整合到一个统一的分析框架中，用于广泛期小细胞肺癌（ES-SCLC），涵盖治疗前空间转录组谱以及患者接受一线PD-L1抑制剂为基础化疗免疫治疗后的临床结局。源数据集及相关临床研究在本记录附带的元数据中引用。源队列包括两项ES-SCLC一线化疗免疫治疗临床试验：GSE261345代表CANTABRICO队列，包含26例接受度伐利尤单抗联合铂类-依托泊苷化疗的患者。GSE261348代表IMfirst队列，包含32例接受阿替利珠单抗联合铂类-依托泊苷化疗的患者。因此，两个队列均代表接受PD-L1抑制剂为基础一线化疗免疫治疗的患者。本数据集通过将源数据协调统一并重构为统一分析框架而构建。在生成ROI水平和患者水平基因表达矩阵的同时，还生成了标准化临床注释、生存结局及衍生分析变量。基因表达值以log₂归一化和Z分数标准化两种格式提供。生存数据包括无进展生存期（PFS）、疾病特异性生存期（DSS）和总生存期（OS）的时间-事件间隔及事件指示符，支持下游预后建模。重要的是，转录组测量所依据的肿瘤标本采集于系统性治疗开始之前。因此，基因表达数据代表治疗前
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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