圈养饲养对隐孢子虫病犊牛模型研究终点的影响数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.hg2g312

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数据集大小约 144.9 KB。

数据说明

背景：腹泻是全球5岁以下儿童的第二大死因，而隐孢子虫属寄生虫是导致该腹泻的主要原因之一。隐孢子虫病造成的全球疾病负担巨大，而唯一获批的化疗药物硝唑尼特对HIV阳性儿童疗效不佳。化疗药物的开发依赖于隐孢子虫病犊牛模型，该模型最能近似模拟人类疾病。然而，该模型在不同研究中应用并不一致。数据收集通常采用两种不同方法：完全粪便收集（CFC），需要使用圈养设施；以及间隔收集（IC），允许使用箱式畜栏。CFC模拟了人类攻击模型的方法学，但圈养设施是否影响研究终点，以及通过该方法收集的数据是否适合推广至人群，尚不清楚。方法：采用改良交叉研究设计，我们比较了CFC和IC，并评估了饲养方式对研究终点的影响。犊牛出生时被随机分配至圈养组（n = 14）或箱式畜栏组（n = 9），或以5 x 107个C.

微小隐孢子虫卵囊，并随访10天。研究终点包括粪便卵囊排出量、腹泻严重程度、脱水程度和血浆皮质醇。结果：圈养犊牛在CFC和IC样本之间，每克粪便干物质中平均对数卵囊计数无显著差异（P = 0.6），卵囊排出也无昼夜变化（P = 0.1）。与栏舍饲养的犊牛相比，圈养犊牛排出的卵囊显著更多（P = 0.05），血浆皮质醇更高（P = 0.001），并且需要更多支持性护理（P = 0.0009）。结论：饲养方式会混淆隐孢子虫病犊牛模型中的研究终点。由于圈养犊牛收集的数据中应激增加，可能无法准确评估化疗药物的疗效

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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