基于MS-HRM的猫科动物年龄估计：健康猫与慢性肾病猫
该数据集来自search.dataone.org，围绕利用甲基化敏感高分辨率熔解（MS-HRM）技术进行猫科动物年龄估计的研究
基本信息
资源简介
基于MS-HRM的猫科动物年龄估计：健康猫与慢性肾病猫
Age estimation using methylation-sensitive high-resolution melting (MS-HRM) in both healthy felines and those with chronic kidney disease
该数据集来自search.dataone.org，围绕利用甲基化敏感高分辨率熔解（MS-HRM）技术进行猫科动物年龄估计的研究。数据覆盖家猫（Felis catus，79份血样）与濒危雪豹（Panthera uncia，11份血样），测量两个基因区域的甲基化率。家猫年龄估计的平均绝对偏差（MAD）为3.83年，且健康状态影响模型准确性，基于慢性肾病（CKD）猫构建的模型准确性低于健康猫。该数据可用于开发与评估DNA甲基化年龄估计方法，并研究健康状态对模型精度的影响（来源 DataONE）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：年龄是野生动物保护中的重要生态学工具。然而，在大多数动物（包括猫科动物——其中大多数濒临灭绝）中，年龄很难估计。在此，我们开发了首个基于DNA甲基化的年龄估计技术——作为当前年龄估计方法的替代方案——用于两个彼此遗传距离相对较远的猫科物种：家猫（Felis catus；79份血样）和一种濒危的豹属动物，雪豹（Panthera uncia；11份血样）。我们使用甲基化敏感高分辨率熔解（MS-HRM）测量了两个基因区域的甲基化率。家猫年龄估计的平均绝对偏差（MAD）为3.83年。健康状况影响了模型的准确性。具体而言，基于患有慢性肾病（CKD）的猫构建的模型准确性低于基于健康猫构建的模型。雪豹
【主题与分类】
主题标签：Felis catus、Ecological Epigenetics、Carnivora、Aging、Panthera uncia、MS-HRM、CpG methylation。本站分类：泌尿生殖系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ac6ad73c33eec588c294b8158a72220d24112b6de4b90fa3bfac11a99fe1e637f
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
年龄是野生动物保护中的一个重要生态工具。然而，在大多数动物中，包括大多数濒危的猫科动物，年龄难以估算。在此，我们针对两种彼此遗传距离相对较远的猫科动物——家猫（Felis catus；79份血液样本）和一种濒危的豹属动物雪豹（Panthera uncia；11份血液样本）——开发了首个基于DNA甲基化的年龄估算技术，作为现有年龄估算方法的替代方案。我们利用甲基化敏感高分辨率熔解曲线（MS-HRM）测定了两个基因区域的甲基化率。家猫年龄估算的平均绝对偏差（MAD）为3.83年。健康状况影响了模型的准确性。具体而言，基于患有慢性肾病（CKD）的猫所构建的模型，其准确性低于基于健康猫所构建的模型。雪豹特异性模型（即为雪豹重新设定模型参数的模型）具有更好的准确……
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