GSE17048多发性硬化外周血表达谱

包含多发性硬化患者和对照外周血基因表达数据,可用于免疫特征筛选、疾病分类、复发相关标志物和通路分析。 该数据集与多发性硬化高度相关,覆盖表格数据内容,可用于分类、特征筛选、算法评估和临床研究。

Gene Expression OmnibusGene Expression Omnibus
NCBI GEO
2009-01-01 更新
浏览 55
表格分类Expression profiling by arrayGPL69479606
GSE17048 Multiple Sclerosis Blood Expression

基本信息

模态
表格
大小
0.02852144 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2009-01-01

资源简介

GSE17048多发性硬化外周血表达谱

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Multiple Sclerosis Blood Cell mRNA Transcriptome》。源站首次发布:Jul 10 200。

【数据内容】

源站原始描述:We measured mRNA expression for all known genes in whole blood from 144 individuals, 99 with MS (43 PPMS, 36 RRMS and 20 SPMS). Analysis of gene expression and genotype in these individuals has indicated the dominant genetic association with T cell regulation is matched by the dominant pattern of dysregulation of T cell gene expression in MS and its clinical subtypes

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL6947、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE17048

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 16 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE17048

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含多发性硬化患者和对照外周血基因表达数据,可用于免疫特征筛选、疾病分类、复发相关标志物和通路分析。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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