小鼠睾丸单细胞RNA测序数据集（PRJCA011018）
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于泌尿生殖系统疾病/男性不育症分类，为小鼠睾丸单细胞RNA测序数据。源站描述显示，高同型半胱氨酸血症（HHcy）在男性不育中起重要作用，研究通过高甲硫氨酸饮食（19.56g/kg）构建HHcy小鼠模型，发现其血清睾酮水平降低，并对HHcy小鼠的Le
基本信息
资源简介
小鼠睾丸单细胞RNA测序数据集（PRJCA011018）
PRJDB43094（PRJCA011018）是一套来源于小鼠睾丸的单细胞RNA测序数据集，在站内归入泌尿生殖系统疾病／男性不育症分类，数据取自ncbi.nlm.nih.gov。该数据集围绕高同型半胱氨酸血症（HHcy）与男性不育的关系展开：研究者通过高甲硫氨酸饮食（19.56g/kg）构建HHcy小鼠模型，观察到其血清睾酮水平降低，并对HHcy小鼠的Leydig细胞转录组进行单细胞RNA测序分析，以探讨背后的机制。数据集主题标签为Other。整体而言，该数据面向男性不育相关机制研究，核心价值在于提供HHcy状态下小鼠睾丸Leydig细胞的单细胞转录组图谱，供研究者了解这一细胞类型在病理条件下的转录特征。
【数据集背景】
源站描述指出，高同型半胱氨酸血症（HHcy）在男性不育中扮演重要角色。为揭示其作用机制，研究采用高甲硫氨酸饮食（19.56g/kg）喂养小鼠以构建HHcy模型，并发现该模型小鼠血清睾酮水平降低。睾酮主要由睾丸Leydig细胞合成与分泌，因此研究者进一步对HHcy小鼠的Leydig细胞转录组开展单细胞RNA测序，希望从细胞与转录本层面寻找HHcy影响睾酮水平及男性生育力的线索。该数据集即在这一研究背景下产生，属于泌尿生殖系统疾病／男性不育症方向的基础研究数据。
【数据内容】
该数据集为小鼠睾丸组织的单细胞RNA测序数据，测序对象聚焦于Leydig细胞的转录组。源站描述明确说明研究对HHcy小鼠的Leydig细胞转录组进行了单细胞RNA测序分析，因此数据内容的核心是HHcy模型小鼠睾丸Leydig细胞的单细胞转录组信息。关于样本数量、测序平台、读长、细胞数、基因数、数据文件格式与体积等具体参数，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名为“PRJDB43094: Single cell RNA-seq from testis of mice (PRJCA011018)”。生物样本为小鼠睾丸，实验干预为高甲硫氨酸饮食（19.56g/kg）诱导的HHcy模型。源站描述提及该模型小鼠血清睾酮水平降低，但未提供血清睾酮测定的具体方法、样本分组数量、动物品系、周龄、饲养条件及测序建库细节，上述内容源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于男性不育症相关机制研究，尤其是围绕HHcy影响睾丸Leydig细胞功能与睾酮合成的研究方向。典型用途包括：在单细胞水平考察HHcy条件下Leydig细胞转录组的改变，探索与睾酮水平降低相关的细胞状态与基因表达特征，以及作为同类小鼠睾丸单细胞RNA测序研究的对照或参考数据。由于数据聚焦Leydig细胞，也适合用于该细胞类型特异性表达特征的分析。具体分析目标需结合研究者自身问题确定，源站未提供预设的分析场景清单。
【使用方法】
使用该数据集时，可先通过来源站ncbi.nlm.nih.gov获取数据，具体下载路径、访问编号与文件组织方式源站未提供。分析上可按单细胞RNA测序的通用流程进行，例如质控、细胞聚类、细胞类型注释与差异表达分析，并结合Leydig细胞的已知特征基因确认细胞身份。由于源站未提供样本分组、细胞数及测序参数等元信息，使用前需自行核对数据文件中的样本信息，相关细节源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为单细胞RNA测序数据，其质量评估指标（如测序深度、细胞存活率、比对率等）源站未提供。限制方面，源站描述仅说明研究对HHcy小鼠Leydig细胞转录组进行了单细胞RNA测序，未提供重复样本数量、对照设置、批次信息及数据验证情况，因此数据的统计效力与可重复性无法从现有信息判断。此外，数据仅涉及小鼠模型，向人类男性不育的推广需谨慎。上述未提及的内容源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、文献出处、版本信息及使用许可条款源站未提供。使用者在引用或再分发数据前，应前往ncbi.nlm.nih.gov查阅该数据集对应的原始记录与相关发表物，以获取准确的引用信息与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB43094
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
高同型半胱氨酸血症（HHcy）在男性不育中起着显著作用。在此，我们报道了通过高蛋氨酸饮食（19.56g/kg）喂养产生的HHcy小鼠血清睾酮水平较低。为了揭示潜在机制，我们进行了单细胞RNA测序，以分析HHcy小鼠间质细胞的转录组。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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