GSE281866:精子尾部纵向柱定位依赖Nsun7(BS-RNA-Seq)

研究聚焦Nsun7基因——一种m5C特异性RNA甲基转移酶,在伸长型精子细胞中与特定RNA相互作用,其失活导致雄性不育。数据可用于探索Nsun7对伸长型精子细胞转录本的调控机制及精子尾部纵向柱定位与运动缺陷的关系(来源 NCBI)

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基因组预测GPL1848010090
GSE281866: Positioning of sperm tail longitudinal columns depend on Nsun7, an RNA binding protein destabilizing elongated spermatid transcripts (BS-RNA-Seq)

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

GSE281866:精子尾部纵向柱定位依赖Nsun7(BS-RNA-Seq)

Positioning of sperm tail longitudinal columns depend on Nsun7, an RNA binding protein destabilizing elongated spermatid transcripts (BS-RNA-Seq)

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件GSE281866_series_matrix.txt.gz,采用BS-RNA-Seq技术对小鼠(10090,GPL18480平台)进行甲基化谱分析。研究聚焦Nsun7基因——一种m5C特异性RNA甲基转移酶,在伸长型精子细胞中与特定RNA相互作用,其失活导致雄性不育。数据可用于探索Nsun7对伸长型精子细胞转录本的调控机制及精子尾部纵向柱定位与运动缺陷的关系(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 14 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):精子细胞的鞭毛在转录沉默的精子细胞中组装,因此依赖于基因表达的转录后调控。已知Nsun7基因突变会导致人类和小鼠的雄性不育。我们将m5C特异性Nsun7 RNA甲基转移酶鉴定为一种存在于伸长型精子细胞中、并与该类型精子前体细胞特异性RNA相互作用的蛋白质。小鼠中Nsun7基因的失活导致其RNA相互作用物上调,从而表明Nsun7下调伸长型精子细胞中的一组RNA。Nsun7基因敲除的生理后果是雄性不育,其机制可通过观察到的纵向柱相对于轴丝微管二联体的错位导致运动缺陷来解释。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18480、10090。本站分类:泌尿生殖系统疾病/男性不育症。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281866

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 24 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

精子细胞的鞭毛在转录沉默的精子细胞中组装,因此依赖于基因表达的转录后调控。已知Nsun7基因突变会导致人类和小鼠的男性不育。我们鉴定出m5C特异性Nsun7 RNA甲基转移酶是一种存在于伸长型精子细胞中的蛋白质,并与该类精子前体细胞特异性的RNA相互作用。在小鼠中失活Nsun7基因会导致其RNA相互作用因子上调,从而表明Nsun7在伸长型精子细胞中下调一组RNA。Nsun7基因敲除的生理后果是男性不育,其机制可通过观察到的纵向柱相对于轴丝微管二联体的错位导致运动缺陷来解释。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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