GSE258973:首次精子发生波中非梗阻性无精子症新型PIWIL4突变的功能研究

该数据集来自NCBI GEO,包含一个高通量测序表达谱文件,聚焦非梗阻性无精子症中新型PIWIL4错义突变(c.805 C>T p.R269W)在首次精子发生波中的功能影响

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GSE258973: Functional Investigation of a Novel PIWIL4 Mutation in Nonobstructive Azoospermia During the First Wave of Spermatogenesis

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

GSE258973:首次精子发生波中非梗阻性无精子症新型PIWIL4突变的功能研究

Functional Investigation of a Novel PIWIL4 Mutation in Nonobstructive Azoospermia During the First Wave of Spermatogenesis

该数据集来自NCBI GEO,包含一个高通量测序表达谱文件,聚焦非梗阻性无精子症中新型PIWIL4错义突变(c.805 C>T p.R269W)在首次精子发生波中的功能影响。研究涉及两名不育男性及携带同源变异的小鼠模型,发现突变损害PIWIL4的piRNA结合能力并导致部分LINE-1元件去抑制。数据可用于分析PIWIL4突变相关的基因表达变化、转座子调控异常及男性不育机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 25 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):PIWI相互作用RNA(piRNAs)是几乎仅在生殖细胞中表达的小非编码RNA,它们通过沉默有害转座子来维持基因组稳定性。据推测,相关的piRNAs引导核内PIWIL4至转座元件,在那里招募DNA甲基化装置并指导从头DNA甲基化。在此,我们在两名不育男性中鉴定出PIWIL4的错义变异(c.805 C>T p.R269W)。尽管携带同源变异雄性纯合敲入小鼠表现出正常的精子计数和形态,但在首次精子发生波期间显示转座元件表达增加和基因表达异常。机制上,突变位点损害PIWIL4的piRNA结合能力,并导致部分LINE-1元件的去抑制。总之,我们鉴定出PIWIL4中的一个piRNA结合突变。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:泌尿生殖系统疾病/男性不育症。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE258973

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 17 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PIWI相互作用RNA(piRNAs)是一类小型非编码RNA,几乎 exclusively 表达于生殖细胞中,其功能是沉默有害的转座子以维持基因组稳定性。有研究提出,相关的piRNAs引导核内的PIWIL4定位至转座元件,招募DNA甲基化机制并指导从头DNA甲基化。本文中,我们在两名不育男性中鉴定出PIWIL4的错义变异(c.805 C>T p.R269W)。尽管携带该同源变异的雄性纯合敲入小鼠表现出正常的精子计数和形态,但在第一次精子发生波期间,它们显示转座子表达增加及基因表达异常。机制上,突变位点损害了PIWIL4的piRNA结合能力,导致部分LINE-1元件的去抑制。总之,我们发现了PIWIL4中的一个piRNA结合突变,该突变可能与人类非梗阻性无精子症有关。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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