人类精子发生单细胞多组学测序揭示与男性减数分裂重组相关的DNA去甲基化事件

该数据集为NCBI GEO上的SuperSeries(GSE235324),主题为人类精子发生单细胞多组学测序,揭示与男性减数分裂重组相关的DNA去甲基化事件

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时间序列预测GPL203019606
GSE235324: Single-cell multi-omics sequencing of human spermatogenesis reveals a DNA demethylation event associated with male meiotic recombination

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

人类精子发生单细胞多组学测序揭示与男性减数分裂重组相关的DNA去甲基化事件

GSE235324 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries,主题为人类精子发生的单细胞多组学测序,旨在揭示与男性减数分裂重组相关的 DNA 去甲基化事件。该数据集归入泌尿生殖系统疾病 / 男性不育症方向,由 Xinyan Yang 提交,发布时间为 Jun 20 202。数据集以高通量测序的甲基化谱分析为主要技术标签,涉及人类(9606)样本与 GPL20301 平台,当前提供 1 个文件,即 GSE235324_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集面向男性生殖生物学与不育症研究场景,为在单细胞与多组学层面考察精子发生过程中的表观遗传变化提供数据基础。

【数据集背景】

精子发生是男性生殖功能的核心过程,涉及精原细胞增殖、减数分裂与精子形成等多个阶段,伴随显著的转录与表观遗传重编程。DNA 甲基化作为重要的表观遗传修饰,在减数分裂与重组过程中可能发生动态变化。该数据集以人类精子发生为研究对象,采用单细胞多组学测序策略,关注与男性减数分裂重组相关联的 DNA 去甲基化事件,属于泌尿生殖系统疾病 / 男性不育症研究方向。源站标题与数据集英文名一致,均指向这一主题。

【数据内容】

该数据集为 SuperSeries,源站描述说明其由下列 SubSeries 组成,具体子系列信息源站未提供。当前可获取的文件数量为 1,文件样例为 GSE235324_series_matrix.txt.gz,即系列矩阵文件,通常用于汇总样本层面的表达或甲基化信号。主题标签包括 Methylation profiling by high throughput sequencing、GPL20301 与 9606,分别指向高通量测序甲基化谱分析、芯片平台编号与人类物种。数据的具体样本数量、细胞类型构成、组学层次组合与甲基化位点规模等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),以 SuperSeries 形式组织,编号 GSE235324,提交作者为 Xinyan Yang,发布时间为 Jun 20 202。源站描述仅说明该 SuperSeries 由所列 SubSeries 构成,未提供样本采集地点、供体信息、伦理审批与测序机构等细节,这些内容源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于人类精子发生过程的表观遗传研究,尤其是单细胞层面 DNA 甲基化动态与减数分裂重组关联的分析;也可用于男性不育症相关机制探索中的参考数据比对。由于主题标签明确为高通量测序甲基化谱分析,适合开展甲基化谱的汇总与再分析。具体分析类型与可支持的结论范围,需以实际数据内容为准,源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE235324_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码差异导致的分析偏差。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析时可能还需结合其 SubSeries 数据,具体子系列信息源站未提供。

【质量与限制】

该数据集当前仅提供 1 个文件,即系列矩阵文件,未提供原始测序数据或其他配套文件的说明,源站未提供。样本量、测序深度、数据完整性评估与质控指标等信息,源站未提供。作为 SuperSeries,其数据细节依赖子系列,而子系列的具体内容源站未提供,使用时应予以注意。

【引用与许可】

引用时应参考数据集编号 GSE235324 及作者 Xinyan Yang,发布时间为 Jun 20 202。数据使用许可与引用规范源站未提供,使用前应查阅 NCBI GEO 的相关政策与源站页面说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE235324

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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