GSE217931：DOT1L通过调控组蛋白-鱼精蛋白替换所需基因的表达促进精子细胞分化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217931

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

在成熟精子头部分化过程中，独特的染色质重塑因子协调核形态的剧烈变化。这一过程的关键步骤是组蛋白向鱼精蛋白的转换，该转换必须正确执行，以避免精子DNA损伤、胚胎致死和雄性不育。在此，我们明确了组蛋白甲基转移酶DOT1L在组蛋白向鱼精蛋白转换中的重要作用。我们发现DOT1L在减数分裂期和减数分裂后生殖细胞中大量表达，且DOT1L催化的组蛋白H3第79位赖氨酸甲基化（H3K79）在组蛋白替换初期的发育中精子细胞中富集。缺乏DOT1L的伸长型精子细胞无法完全替换组蛋白，并表现出鱼精蛋白募集异常，导致精子头部畸形和雄性不育。DOT1L缺失导致转录失调，该失调与组蛋白替换的开始同时发生，并影响组蛋白向鱼精蛋白转换所需的基因。DOT1L还沉积H3K79me2并促进延伸型RNA聚合酶II在睾丸特异性溴结构域基因Brdt处的积累。

总之，我们的结果表明，DOT1L是精子细胞分化过程中转录的重要介导者，也是男性生育力不可或缺的调节因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。