modulo突变体总RNA-seq揭示转录组广泛变化

modulo突变体已知会导致男性不育,但机制不明,本研究旨在利用RNA-seq数据探究不育机制。数据覆盖转录组表达谱,可用于分析modulo突变引起的转录组广泛变化,进而预测或推断与男性不育相关的分子机制(来源 NCBI)

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基因组预测GPL172757227
GSE214456: Total RNA-seq in the modulo mutant reveals broad changes to the transcriptome.

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

modulo突变体总RNA-seq揭示转录组广泛变化

GSE214456 是一项针对 modulo 突变体开展的总 RNA-seq 研究,其标题表明该数据集揭示了转录组的广泛变化。该数据集归类于泌尿生殖系统疾病下的男性不育症方向,来源于 NCBI。已知 modulo 突变会导致男性不育,但其原因长期不明,本研究正是希望借助 RNA-seq 数据作为探究不育机制的一部分。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE214456_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL17275 平台以及物种编号 7227,作者为 Jun,I,Park,发布时间为 Sep 29 202。整体而言,该数据集提供了 modulo 突变体转录组表达谱,可用于分析突变引起的转录组广泛变化,进而为推断与男性不育相关的分子机制提供数据基础。

【数据集背景】

modulo 突变体已被认为会导致男性不育,但其具体原因一直未能明确。为深入调查这一不育现象背后的机制,研究者开展了总 RNA-seq 实验,并将 RNA-seq 数据作为整个机制研究的一部分。该数据集即围绕这一目的产生,主题聚焦于 modulo 突变体转录组的整体变化,属于男性不育症相关的基础研究数据。

【数据内容】

该数据集为总 RNA-seq 表达谱数据,主题标签显示其属于“Expression profiling by high throughput sequencing”,涉及 GPL17275 平台和物种编号 7227。数据集共包含 1 个文件,文件样例为 GSE214456_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。数据内容覆盖转录组表达谱,可用于观察 modulo 突变引起的转录组广泛变化。

【采集与来源】

数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Total RNA-seq in the modulo mutant reveals broad changes to the transcriptome.”。作者为 Jun,I,Park,发布时间为 Sep 29 202。源站描述指出,该研究旨在利用 RNA-seq 数据作为调查不育机制的一部分。除上述信息外,样本采集的具体流程、测序细节与实验条件源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于分析 modulo 突变引起的转录组广泛变化,并可在男性不育症研究背景下,用于预测或推断与不育相关的分子机制。其高通量测序表达谱特征使其可用于转录组层面的差异分析与表达模式考察。更具体的应用场景与验证结论源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE214456_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以保证后续分析的准确性。关于数据处理流程与统计方法的更多细节源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,文件样例为 GSE214456_series_matrix.txt.gz。除文件数量与格式外,样本量、测序深度、重复设置及质控指标等信息源站未提供,因此在使用时需结合源站进一步核实。该数据集的结论适用范围应限定于 modulo 突变体转录组表达谱分析,不宜外推至其他情形。

【引用与许可】

作者为 Jun,I,Park,发布时间为 Sep 29 202。数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用规范与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE214456

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

已知Modulo突变体会导致男性不育,尽管其原因尚不清楚。本研究旨在利用RNA-seq数据作为探究不育机制的一部分。

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