GSE214201：一个古老的睾丸特异性IQ基序包含H基因调控精子发生过程中的特异性异构体表达

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE214201

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数据说明

生精细胞表达的可变剪接RNA多于大多数完整组织；然而，这些事件的调控机制仍不清楚。本文中，我们表征了一个睾丸特异性含IQ基序H基因（Iqch）的功能，其表达在所有已分析的哺乳动物物种中均被证实为睾丸特异性，但其作用仍不明确。利用突变小鼠模型，我们发现Iqch对于精子发生过程中RNA异构体的特异性表达至关重要。通过对成年小鼠睾丸的免疫组织化学分析，我们注意到Iqch定位于体细胞和生殖细胞中，包括精原细胞、精母细胞和圆形精子细胞。此外，Iqch主要在精母细胞和精子细胞阶段的细胞核中表达，其中IQCH与SRRM2和ERSP1并置，提示这些蛋白质之间的相互作用调控可变剪接（AS）。通过RNA-seq，我们注意到突变Iqch导致基因表达改变，包括精子细胞阶段睾丸特异性lncRNA和蛋白质编码基因的明显下调，以及AS修饰，主要是内含子保留增加，导致完全男性不育。

有趣的是，野生型Iqch的存在使我们能够识别新的剪接转录本，而突变型Iqch则改变了数百种RNA异构体的表达和使用，有利于经典形式的表达。这表明Iqch是剪接控制机制的一部分，在生殖细胞生物学中至关重要。我们的发现揭示了Iqch在精子发生中的作用，并为控制RNA异构体表达的分子机制提供了线索，主要是在精子发生的最后阶段。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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