20日龄小鼠睾丸Pa1-/-与Pa1F/F支持细胞转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE188308

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

血睾屏障（BTB）对精子发生的微环境至关重要，而支持细胞为BTB的构建提供了细胞学基础。众多核转录因子已被证实对支持细胞的正常功能至关重要。PA1已被报道在多种生物学过程中发挥重要作用，但其在雄性生殖中的潜在功能仍不清楚。在此，我们发现PA1在人和小鼠睾丸中高表达，并主要定位于支持细胞的细胞核中。支持细胞特异性Pa1敲除导致小鼠出现类无精子症表型。该基因的敲除导致精子发生过程中出现多种缺陷，如基底和顶端外质特化过程中细胞骨架的解体以及BTB的破坏。进一步的转录组分析，结合支持细胞中PA1的Cut-Tag结果，揭示PA1可影响一部分对支持细胞正常功能至关重要的基因的表达，包括与肌动蛋白组织和细胞连接相关的基因，如Connexin43（Cx43）。

我们进一步证实，Cx43的表达依赖于AP-1复合体转录因子之一JUN与PA1之间的相互作用。总体而言，我们的研究结果表明，PA1对于支持细胞中BTB完整性的维持至关重要，并通过转录因子调控BTB构建相关基因的表达。因此，支持细胞中这一新发现的机制为部分无精子症个体提供了潜在的诊断甚至治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。