姐妹染色单体黏连由单个cohesin复合物介导

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源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ac0922325aa4aa4001d1c1f754aadfdf9a9c197721e5393c7bba1699240b51fa6

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数据说明

真核生物基因组通过环挤压和姐妹染色单体黏连进行组织，两者均由多聚黏连蛋白复合体介导。要理解黏连蛋白如何将姐妹DNA保持在一起，以及黏连丧失如何导致女性年龄相关的不孕，需要了解黏连蛋白在体内的化学计量。利用定量超分辨率成像，我们在复制后的人类细胞中鉴定出两个离散的染色质结合黏连蛋白群体。大多数复合体表现为二聚体，而定位到姐妹染色单体黏连位点并与Sororin相关的黏连蛋白则完全是单体。Sororin：黏连蛋白复合体的单体化学计量表明，姐妹染色单体黏连是由单个黏连蛋白环赋予的，这是黏连源于它们共同捕获姐妹DNA这一提议的关键预测。以下是关于样本如何染色和图像如何获取的信息，按显微镜技术分类。免疫荧光染色 细胞在22x22 mm #1.5H高精度盖玻片（厚度0.170 ± 0.005 mm，Marienfeld Superior）上生长至80%汇合度。

细胞用PBS洗涤，在冰预冷的含0.2% Triton X-100（Sigma-Aldrich）的PBS中于冰上预提取1.5分钟，然后在4%甲醛中固定15分钟。对于未预提取的样品，细胞先固定，随后在含0.2% Triton X-100的PBS中透化5分钟。一抗和二抗用抗体稀释液（含10% FBS、0.05%叠氮化钠、经0.2 mm无菌过滤的DMEM培养基）稀释。样品在一抗中孵育1.5小时，然后在补充有4’,6’-二脒基-2-苯基吲哚二盐酸盐（DAPI，0.5 mg/ml）的二抗溶液中孵育1小时。在一抗和二抗染色之间，样品用含0.2% Tween的PBS洗涤3次。二抗孵育后，样品被洗…， # 姐妹染色单体黏连由单个黏连蛋白复合体介导 [在Dyrad上访问此数据集]（DOI:10.5061/dryad.3r2280gpg） E

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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