公牛生育力状态对牛子宫内膜受孕体诱导转录组反应的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205404

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探讨种公牛生育力状态对子宫内膜转录组中受孕体诱导变化的影响。从爱尔兰全国人工授精公牛群体中（每头公牛至少500次授精），基于校正生育力评分（高生育力：+4.37%，低生育力：-12.7%；平均值=0%）选取了荷斯坦弗里斯兰公牛（3头高生育力，HF；3头低生育力，LF）。为生成延长的受孕体，将使用这6头公牛精子体外生产的第7天囊胚以5-10个为一组移植至同期发情母牛（每头公牛n=7头母牛；共42头母牛）。于第15天屠宰后回收受孕体（回收率：HF 59.4% vs. LF 45.0%；P<0.05）。同时，从同期发情周期母牛（n=4）中回收第15天子宫内膜外植体。每头母牛的外植体在RPMI培养基中分别与以下物质共培养6小时：(i) 无添加物，对照；(ii) 100 ng/ml绵羊重组干扰素tau（IFNT）；(iii) 来自每头高生育力公牛的单一个受孕体；或(iv) 来自每头低生育力公牛的单一个受孕体。为尽量减少变异，同一子宫的外植体用于所有处理，并在4头母牛中重复。

6小时后，外植体经速冻处理并保存于-80°C。提取的mRNA进行RNA测序（Illumina NextSeq 500平台），所得数据通过R软件中的生物信息学流程进行分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。