人丙氨酸:乙醛酸氨基转移酶的晶体结构
该数据集包含通过X射线衍射测定的人丙氨酸:乙醛酸氨基转移酶（AGT）的蛋白质晶体结构数据，涉及蛋白质三维坐标及配体等分子模态，主要用于研究AGT的酶学结构、其与原发性高草酸尿症1型基因型-表型关联，以及为相关遗传代谢疾病的药物靶点开发提供结构基础。
基本信息
资源简介
该数据集提供了人丙氨酸:乙醛酸氨基转移酶（AGT）的晶体结构数据，其结构通过X射线衍射方法在2.5埃分辨率下测定。数据集包含蛋白质三维坐标及配体信息，如（氨基氧基）乙酸、甘油和吡哆醛-5'-磷酸等。数据来源于蛋白质数据库日本（PDB Japan），由Zhang等人于2003年发表，旨在阐明AGT酶的结构特征及其与原发性高草酸尿症1型（一种遗传性代谢疾病）基因型与酶表型之间的关系，主要用于结构生物学、酶学机制研究和遗传疾病相关药物靶点探索。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://pdbj.org/mine/summary/1h0c
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集提供了人丙氨酸:乙醛酸氨基转移酶（AGT）的晶体结构数据，其结构通过X射线衍射方法在2.5埃分辨率下测定。数据集包含蛋白质三维坐标及配体信息，如（氨基氧基）乙酸、甘油和吡哆醛-5’'-磷酸等。数据来源于蛋白质数据库日本（PDB Japan），由Zhang等人于2003年发表，旨在阐明AGT酶的结构特征及其与原发性高草酸尿症1型（一种遗传性代谢疾病）基因型与酶表型之间的关系，主要用于结构生物学、酶学机制研究和遗传疾病相关药物靶点探索。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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