良性前列腺增生上皮与基质差异表达基因数据集
该数据集来自 NCBI GEO,聚焦良性前列腺增生(BPH)上皮与基质之间的基因表达差异。研究者通过激光显微切割从 BPH 患者样本中分离上皮和基质,并使用 Affymetrix HG-U133_Plus_2 基因芯片检测和比较基因表达水平

基本信息
资源简介
良性前列腺增生上皮与基质差异表达基因数据集
Different expressed genes in epithelium and stromal of Benign Prostatic Hyperplasia
该数据集来自 NCBI GEO,聚焦良性前列腺增生(BPH)上皮与基质之间的基因表达差异。研究者通过激光显微切割从 BPH 患者样本中分离上皮和基质,并使用 Affymetrix HG-U133_Plus_2 基因芯片检测和比较基因表达水平。数据集包含 1 个文件(GSE31323_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及表达谱芯片、GPL570 平台和人类(9606)。该数据可用于识别 BPH 上皮与基质中差异表达的基因,支持前列腺增生相关分子机制与潜在标志物的探索性分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 10 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):为了识别良性前列腺增生(BPH)上皮和基质中差异表达的基因,我们通过激光显微切割从良性前列腺增生患者中收集上皮和基质。然后,使用 Affymetrix HG-U133_Plus_2 基因芯片检测并比较基因的表达水平。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:泌尿生殖系统疾病/良性前列腺增生。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE31323
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE31323
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
为识别良性前列腺增生(BPH)上皮和间质中差异表达的基因,我们通过激光显微切割技术从良性前列腺增生患者中收集上皮和间质组织。随后,使用Affymetrix HG-U133_Plus_2基因芯片检测并比较基因的表达水平。旨在找出在上皮和间质中表达最为丰富的基因,以及这些基因在BPH发病机制中的作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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