DECIPHER PIK3CA基因表型数据
DECIPHER PIK3CA Gene Overview 是与血管畸形(Vascular malformations)相关的公开数据资源,主要包含PIK3CA相关拷贝数变异、序列变异和表型关联概览数据,数据模态为表格,适合用于分类、模型训练、基准评测或临床特征分析。

基本信息
资源简介
DECIPHER PIK3CA基因表型数据
【一句话概览】
PIK3CA 是位于正链的基因,编码磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸 3-激酶催化亚基 α,又称 PI3K,Ensembl 编号 ENSG00000121879。其功能为磷酸肌醇 3-激酶在肌醇环第 3 位磷酸化磷脂酰肌醇及其磷酸化衍生物,生成 3-磷酸磷脂酰肌醇,并利用 ATP 和 PtdIns(4,5)P2。DECIPHER 在该基因中收录 12 个序列变异,来自 12 名开放获取受试者(来源 deciphergenomics.org)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《PIK3CA》。
【数据内容】
源站原始描述:Forward strand gene: phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha Also known as: PI3K, ENSG00000121879 Function: Phosphoinositide-3-kinase (PI3K) phosphorylates phosphatidylinositol (PI) and its phosphorylated derivatives at position 3 of the inositol ring to produce 3-phosphoinositides (PubMed:15135396, PubMed:23936502, PubMed:28676499). Uses ATP and PtdIns(4,5)P2 (phosphatidylinositol 4,5… Show more Source: UniProt DECIPHER holds 12 sequence variants in this gene, in…
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):正向链基因:磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α 又称:PI3K,ENSG00000121879 功能:磷酸肌醇-3-激酶(PI3K)在肌醇环的第3位磷酸化磷脂酰肌醇(PI)及其磷酸化衍生物,生成3-磷酸肌醇(PubMed:15135396, PubMed:23936502, PubMed:28676499)。利用ATP和PtdIns(4,5)P2(磷脂酰肌醇4,5… 显示更多 来源:UniProt DECIPHER在该基因中拥有12个序列变异,涉及12名开放获取患者
【主题与分类】
主题标签:PIK3CA、PI3K、ENSG00000121879、phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-、sequence variants、DECIPHER。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.deciphergenomics.org/gene/PIK3CA/overview
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.deciphergenomics.org/gene/PIK3CA/overview
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DECIPHER PIK3CA基因表型数据包含PIK3CA相关拷贝数变异、序列变异和表型关联概览数据,可用于血管畸形相关的分类研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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