基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

颅面与牙科遗传学中心（CCDG）：口面裂、亚型及亚临床表型的遗传学研究 - CIDR

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 807788，标题为“Center for Craniofacial and Dental Genetics (CCDG): Genetics of Orofacial Clefts, Sub-types, and Subclinical Phenotypes - CIDR”。它由颅面与牙科遗传学中心（CCDG）发起，聚焦口面裂、其亚型及亚临床表型的遗传学研究，相关数据由 CIDR 提供。作为 BioProject 体系中的一项记录，它汇集了与这一单一研究计划相关的多种生物数据，便于用户从一个入口查找该项目所产生的不同类型数据。该数据集在分类上属于口腔疾病 / 其他，主题标签为表型或基因型，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

BioProject 是围绕单一研究计划组织起来的生物数据集合，这些计划通常来自一个机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，用于查找为该项目生成的各种数据类型。该数据集所对应的研究计划，由颅面与牙科遗传学中心（CCDG）发起，研究主题为口面裂、其亚型及亚临床表型的遗传学。数据由 CIDR 提供。该数据集在来源站上的标识为 BioProject ID 807788，标题中同时包含了机构名称、研究主题以及 CIDR 这一数据提供方信息。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“表型或基因型”，表明其内容涉及表型与基因型相关数据。研究聚焦于口面裂、其亚型及亚临床表型，属于口腔疾病范畴下的遗传学研究。作为 BioProject 记录，它并不局限于单一数据类型，而是汇集了与该项目相关的多种生物数据，用户可通过该记录查找指向不同数据类型的链接。源站未提供关于样本数量、具体表型字段、基因分型平台、变异位点、统计结果等更细粒度的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，对应 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，编号为 807788。其研究计划由颅面与牙科遗传学中心（CCDG）发起，数据由 CIDR 提供。BioProject 记录本身来源于单一组织或联盟，用于整合该计划下产生的各类生物数据。源站未提供关于样本采集地点、采集时间、受试者招募方式、伦理审批信息、具体实验流程等采集细节。

【适用场景】

该数据集适用于围绕口面裂、其亚型及亚临床表型的遗传学研究进行数据查找与整合。由于主题标签涉及表型或基因型，它可用于需要同时关注表型信息与基因型信息的研究场景。作为 BioProject 记录，它适合作为入口，帮助用户定位该项目下不同数据类型的链接。源站未提供关于具体分析场景、疾病关联分析、人群遗传学分析等更具体的适用说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 807788）访问该数据集，并借助该记录查找为该项目生成的各种数据类型所对应的链接。BioProject 记录的设计目的即在于提供单一位置以发现相关数据。源站未提供关于数据下载格式、访问权限、API 调用方式、数据处理步骤等具体使用方法说明。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量控制、数据完整性、样本量、覆盖度、偏差、版本更新等方面的具体信息。已知信息仅包括其来源为 NCBI BioProject、编号为 807788、由 CCDG 发起、CIDR 提供数据，以及研究主题为口面裂、其亚型及亚临床表型的遗传学。除此之外的质量指标与限制条件，源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求。用户如需引用或使用，应参考 NCBI BioProject 记录及数据提供方 CIDR 的相关规定。源站未提供具体许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA807788

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA807788

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目的目的是识别导致非综合征性口面裂（OFCs）、常见亚型及相关亚临床表型的遗传因素。OFCs最常见的亚型为单纯唇裂（CL）、唇裂伴腭裂（CLP）和单纯腭裂（CP）。CL和CLP可为单侧（左侧或右侧）或双侧。相关的亚临床表型包括隐性唇部肌肉缺陷、颅面形态特征及细微言语异常，这些表型分布于患者家系中，可能反映了潜在的遗传易感性，为揭示OFC病因提供线索。该多族裔数据集包含从宾夕法尼亚州、波多黎各、哥伦比亚、菲律宾、尼日利亚和加纳招募的参与者，并包括……（更多内容见dbGaP研究页面。）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别