CCDG：危地马拉龋齿与唇腭裂研究

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/dbgap/phs000440

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究提供了一个机会，可以在危地马拉确定的一组家庭中同时调查龋齿和口面部裂（OFCs）的遗传学。本研究是基因环境关联研究计划（GENEVA，http://www.genevastudy.org）的一部分，该计划是通过跨NIH基因、环境和健康倡议（GEI）发展起来的。此外，本研究汇集了匹兹堡大学颅面与牙科遗传学中心（www.ccdg.pitt.edu）的多个研究重点。在Broad Institute对包含610,000个SNPs的全基因组面板进行了基因分型，以便与我们其他相关的GENEVA研究相媲美，这些研究也是dbGaP的一部分（dbGaP登录号phs000095，“龋齿：全基因组关联和基因x环境研究”和dbGaP登录号phs000094，“识别控制口腔裂的基因和相互作用的国际联盟”）。本研究的目标是在一个新的研究人群中调查龋齿和OFCs的遗传决定因素。迄今为止，大多数龋齿的遗传学研究是在白种人中进行的，而OFCs的研究则是在白种人和亚洲人中进行的。

所研究的危地马拉人口为农村人口，族裔混杂，其中南美原住民比例较高。该数据集中的36名危地马拉人同时也参与了近期的唇裂和腭裂GWAS研究（Beaty等，2010年和2011年，dbGaP研究登录号：phs000094，“国际联盟识别控制口裂的基因及相互作用”）。除在危地马拉确定的家庭外，部分受试者与本研究队列一起进行了基因分型，以扩充母研究GENEVA研究（龋齿：全基因组关联及基因×环境研究，dbGaP登录号phs000095）的数据，特别是来自IOWA和PITT GENEVA研究中心的个体。他们的数据可随母研究获取。龋齿（又称蛀牙）仍是最常见的慢性疾

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。