多形性腺瘤与癌在多形性腺瘤中单细胞数据

GSE294254 Pleomorphic Adenoma and Carcinoma ex Pleomorphic Adenoma scRNA-seq 是与多形性腺瘤(Pleomorphic adenoma)相关的公开数据资源,主要包含多形性腺瘤及癌在多形性腺瘤中相关单细胞测序数据,数据模态为表格,适合用于分类、模型训练、基准评测或临床特征分析。

NCBI GEONCBI GEO
Gene Expression Omnibus
2025-01-01 更新
浏览 37
表格分类GPL246769606
GSE294254 Pleomorphic Adenoma and Carcinoma ex Pleomorphic Adenoma scRNA-seq

基本信息

模态
表格
大小
0.600834503 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2025-01-01

资源简介

多形性腺瘤与癌在多形性腺瘤中单细胞数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Single-cell transcriptomics reveals cellular evolution underlying pleomorphic adenoma recurrence and malignant transformation》。源站首次发布:Apr 10 202。

【数据内容】

源站原始描述:Pleomorphic adenoma (PA), the most common benign salivary gland tumor, presents unpredictable risks of recurrence and malignant transformation into carcinoma ex pleomorphic adenoma (CXPA), posing significant clinical challenges. To better delineate the tumor progression trajectory, we performed single-cell RNA sequencing on normal salivary glands, primary PA, recurrent PA (rPA), and CXPA, integrating cell trajectory reconstruction, differential gene expression analysis, and key gene network expl…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294254

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 24 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多形性腺瘤与癌在多形性腺瘤中单细胞数据包含多形性腺瘤及癌在多形性腺瘤中相关单细胞测序数据,可用于多形性腺瘤相关的分类研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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