颅面短小症:加速理解其重要性与病因(CAUSE)
该数据集是一个专注于颅面短小症(CFM)遗传病因研究的基因组数据集,包含全基因组测序、靶向捕获测序及基因表达等多模态数据,涉及170个核心家系和490名患者的样本,旨在通过识别候选基因和突变、分析发育相关通路,揭示CFM的遗传风险因素,为分子诊断、临床管理和颅面发育机制研究提供支持。
基本信息
资源简介
该数据集聚焦于颅面短小症(CFM),一种常见的先天性颅面畸形(发病率约1:3500),涉及面部骨骼、耳朵、面神经及其他颅外结构异常。数据集旨在通过遗传学研究揭示CFM的病因,内容包括:利用全基因组测序分析170个核心家系(患者与父母)以发现新候选基因;通过靶向捕获测序在490名CFM患者中检测50个候选基因突变;结合人类及动物模型的组织基因表达研究,探索导致CFM表型的基因及通路。数据来源于FACIAL网络(NIH资助的多中心研究网络),通过回顾性样本库和前瞻性招募收集。主要研究方向包括遗传风险因素鉴定、分子诊断开发及颅面发育调控机制探索,可为CFM及其他颅面疾病的临床管理、遗传咨询和预防策略提供科学依据。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.facebase.org/chaise/record/#1/isa:project/RID=3S-5MYT
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于颅面短小症(CFM),一种常见的先天性颅面畸形(发病率约1:3500),涉及面部骨骼、耳朵、面神经及其他颅外结构异常。数据集旨在通过遗传学研究揭示CFM的病因,内容包括:利用全基因组测序分析170个核心家系(患者与父母)以发现新候选基因;通过靶向捕获测序在490名CFM患者中检测50个候选基因突变;结合人类及动物模型的组织基因表达研究,探索导致CFM表型的基因及通路。数据来源于FACIAL网络(NIH资助的多中心研究网络),通过回顾性样本库和前瞻性招募收集。主要研究方向包括遗传风险因素鉴定、分子诊断开发及颅面发育调控机制探索,可为CFM及其他颅面疾病的临床管理、遗传咨询和预防策略提供科学依据。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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