基本信息

模态

蛋白质

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-11

资源简介

人类健康与BRONJ下颌骨样本DIA蛋白质组学数据

本数据集为人类下颌骨组织的数据非依赖性采集（DIA）液相色谱-串联质谱（LC–MS/MS）蛋白质组学图谱，样本来源于双膦酸盐相关颌骨骨坏死（BRONJ）患者与健康对照。数据集英文名称为 DIA proteomics of human healthy and BRONJ mandible samples，在来源站归入口颌系统疾病 / 双膦酸盐相关颌骨骨坏死分类，主题标签为 Proteomics。其核心价值在于以 DIA 模式对下颌骨组织进行蛋白质组学刻画，并通过比较分析揭示 BRONJ 样本中的关键改变，为理解该疾病的分子层面变化提供蛋白质组数据基础。

【数据集背景】

双膦酸盐相关颌骨骨坏死是口颌系统疾病中一类与双膦酸盐使用相关的颌骨病变。本数据集聚焦于人类下颌骨组织，将 BRONJ 患者样本与健康对照样本并列纳入蛋白质组学分析，旨在从蛋白质层面呈现两组样本之间的差异。来源站描述指出，比较分析揭示了 BRONJ 样本中的关键改变，说明该数据集不仅包含原始蛋白质组图谱，也包含基于比较的分析结果，可用于支撑后续对 BRONJ 分子机制的探索。

【数据内容】

数据集的内容为人类下颌骨组织的 DIA LC–MS/MS 蛋白质组学图谱，覆盖 BRONJ 患者与健康对照两类样本。蛋白质鉴定与定量在 1% FDR 阈值下进行，并采用基于强度的归一化处理。来源站描述提到，比较分析揭示了 BRONJ 样本中的关键改变，但未提供具体差异蛋白名称、数量或通路信息。样本组织为冷冻组织，属于人类下颌骨组织来源。

【采集与来源】

样本处理流程包括苯酚-甲醇提取、基于 SP3 的净化以及胰蛋白酶消化，随后进行高分辨率 LC–MS/MS 的 DIA 模式采集。蛋白质鉴定与定量在 1% FDR 截止值下完成，并采用基于强度的归一化。数据来源站为 omicsdi.org。除上述流程与来源站信息外，样本量、患者临床信息、采集仪器型号、色谱梯度等细节源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于口颌系统疾病尤其是双膦酸盐相关颌骨骨坏死的蛋白质组学研究场景，可用于比较 BRONJ 与健康下颌骨组织之间的蛋白质表达差异，也可作为 DIA 蛋白质组学方法在颌骨组织样本中应用的参考。由于主题标签为 Proteomics，其典型用途包括蛋白质鉴定、定量比较以及差异蛋白质筛选等下游分析。具体应用方向需结合源站未提供的临床与实验设计信息进一步确定。

【使用方法】

使用该数据集时，可基于其 DIA LC–MS/MS 蛋白质组图谱开展蛋白质鉴定与定量结果的再利用。来源站描述中提及的 1% FDR 阈值与基于强度的归一化可作为理解数据定量特征的依据。若需复现或扩展比较分析，应参考苯酚-甲醇提取、SP3 净化与胰蛋白酶消化的样本处理流程，以及高分辨率 LC–MS/MS 的 DIA 采集模式。数据的具体文件格式、检索数据库、软件参数等源站未提供。

【质量与限制】

该数据集在蛋白质鉴定与定量中采用 1% FDR 阈值，并进行了基于强度的归一化，这些是来源站描述中明确的质量控制相关设置。限制方面，源站未提供样本量、患者分组细节、临床元数据、技术重复情况以及独立验证结果等信息，因此无法评估其统计效力与外部可推广性。此外，比较分析所揭示的关键改变的具体内容源站未提供，使用者在解释差异时需注意这一信息缺口。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。关于引用方式、许可协议、使用条款以及原始数据提供方的具体信息，源站未提供。

原始链接

https://omicsdi.org/dataset/iprox/PXD068365

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/iprox/PXD068365

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含来自双膦酸盐相关性颌骨坏死（BRONJ）患者和健康对照者的下颌骨组织的数据非依赖性采集（DIA）LC–MS/MS蛋白质组学图谱。冷冻组织经苯酚-甲醇提取、基于SP3的净化和胰蛋白酶消化处理，随后在DIA模式下进行高分辨率LC–MS/MS分析。在1% FDR阈值下进行蛋白质鉴定和定量，并采用基于强度的归一化。比较分析揭示了BRONJ样本中的关键变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别