结节性硬化症中胚胎神经元标志物的单细胞分子病理学研究
该数据集基于石蜡包埋的脑组织样本,通过单细胞分子病理学技术,整合了免疫组织化学标记和mRNA扩增数据,包含细胞图像、基因表达(如nestin、Ki-67等mRNA)和蛋白质表达等多模态信息,主要用于研究结节性硬化症中神经元成熟障碍和细胞周期调控异常的分子机制,为神经发育疾病和癫痫病理学提供单细胞水平的基因表达分析依据。
基本信息
资源简介
该数据集是针对结节性硬化症(TSC)脑组织样本的单细胞分子病理学研究。数据集包含从五名TSC患者脑组织样本中获取的细胞数据,重点关注异常神经元和巨细胞中的分子表型。数据来源为石蜡包埋的脑组织标本,通过免疫组织化学标记和单细胞mRNA扩增技术(如逆转录Northern印迹)构建,检测了包括巢蛋白(nestin)、细胞周期标志物(如Ki-67、增殖细胞核抗原)以及细胞骨架元件和合成酶在内的多种mRNA和蛋白质表达。主要研究方向为探索TSC中细胞周期调控和神经元成熟过程的异常机制,应用于神经发育疾病、癫痫病理学及单细胞基因表达分析等领域。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC19509/
标准获取流程:
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是针对结节性硬化症(TSC)脑组织样本的单细胞分子病理学研究。数据集包含从五名TSC患者脑组织样本中获取的细胞数据,重点关注异常神经元和巨细胞中的分子表型。数据来源为石蜡包埋的脑组织标本,通过免疫组织化学标记和单细胞mRNA扩增技术(如逆转录Northern印迹)构建,检测了包括巢蛋白(nestin)、细胞周期标志物(如Ki-67、增殖细胞核抗原)以及细胞骨架元件和合成酶在内的多种mRNA和蛋白质表达。主要研究方向为探索TSC中细胞周期调控和神经元成熟过程的异常机制,应用于神经发育疾病、癫痫病理学及单细胞基因表达分析等领域。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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